We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorDmrtb1
ModelDMRTB_MOUSE.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length18
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusnbdGhWACATTGTWdChn
Best auROC (human)
Best auROC (mouse)0.9
Peak sets in benchmark (human)
Peak sets in benchmark (mouse)3
Aligned words460
TF familyDMRT {2.5.1}
TF subfamilyDMRTB1 {2.5.1.0.6}
MGIMGI:1927125
EntrezGeneGeneID:56296
(SSTAR profile)
UniProt IDDMRTB_MOUSE
UniProt ACA2A9I7
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 7.58276
0.0005 9.73816
0.0001 14.33576
GTEx tissue expression atlas Dmrtb1 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0117.028.041.037.012.025.06.065.011.018.015.030.08.025.036.042.0
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032.01.075.02.02.03.019.02.09.00.0113.06.02.07.0167.06.0
0411.02.00.02.01.08.00.02.0124.0153.08.089.03.04.02.07.0
0525.018.02.094.053.014.01.099.06.02.02.00.019.07.00.074.0
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081.00.00.01.0296.05.03.097.00.00.00.04.02.01.00.06.0
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100.00.00.00.00.00.00.00.012.02.01.080.043.03.04.0271.0
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122.00.00.08.03.00.01.09.02.03.03.0368.02.02.02.011.0
136.01.00.02.04.00.00.01.01.02.00.03.0226.018.030.0122.0
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157.083.05.07.09.010.00.02.08.0117.02.02.011.0145.01.07.0
1610.014.04.07.0127.0120.021.087.04.02.01.01.04.07.01.06.0
1750.031.046.018.074.026.05.038.09.08.06.04.017.024.034.026.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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04-0.841-2.407-4.248-2.407-2.953-1.147-4.248-2.4071.5511.76-1.1471.22-2.056-1.796-2.407-1.274
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07-2.9532.684-1.796-1.42-4.248-2.056-4.248-4.248-4.248-2.056-4.248-4.248-2.953-1.034-4.248-2.056
08-2.953-4.248-4.248-2.9532.419-1.59-2.0561.306-4.248-4.248-4.248-1.796-2.407-2.953-4.248-1.42
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10-4.248-4.248-4.248-4.248-4.248-4.248-4.248-4.248-0.757-2.407-2.9531.1140.497-2.056-1.7962.331
11-1.274-2.0560.52-2.953-4.248-2.407-2.407-2.953-4.248-2.953-1.796-4.248-2.056-1.2742.516-0.54
12-2.407-4.248-4.248-1.147-2.056-4.248-2.953-1.034-2.407-2.056-2.0562.637-2.407-2.407-2.407-0.841
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15-1.2741.151-1.59-1.274-1.034-0.933-4.248-2.407-1.1471.493-2.407-2.407-0.8411.707-2.953-1.274
16-0.933-0.607-1.796-1.2741.5751.518-0.211.198-1.796-2.407-2.953-2.953-1.796-1.274-2.953-1.42
170.6470.1740.564-0.3611.0370.0-1.590.375-1.034-1.147-1.42-1.796-0.417-0.0790.2650.0