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Model info
Transcription factorDmrtb1
ModelDMRTB_MOUSE.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length18
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusnbdGhWACATTGTWdChn
Best auROC (human)
Best auROC (mouse)0.9
Peak sets in benchmark (human)
Peak sets in benchmark (mouse)3
Aligned words460
TF familyDMRT {2.5.1}
TF subfamilyDMRTB1 {2.5.1.0.6}
MGIMGI:1927125
EntrezGeneGeneID:56296
(SSTAR profile)
UniProt IDDMRTB_MOUSE
UniProt ACA2A9I7
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 7.58276
0.0005 9.73816
0.0001 14.33576
GTEx tissue expression atlas Dmrtb1 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0117.028.041.037.012.025.06.065.011.018.015.030.08.025.036.042.0
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032.01.075.02.02.03.019.02.09.00.0113.06.02.07.0167.06.0
0411.02.00.02.01.08.00.02.0124.0153.08.089.03.04.02.07.0
0525.018.02.094.053.014.01.099.06.02.02.00.019.07.00.074.0
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100.00.00.00.00.00.00.00.012.02.01.080.043.03.04.0271.0
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122.00.00.08.03.00.01.09.02.03.03.0368.02.02.02.011.0
136.01.00.02.04.00.00.01.01.02.00.03.0226.018.030.0122.0
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157.083.05.07.09.010.00.02.08.0117.02.02.011.0145.01.07.0
1610.014.04.07.0127.0120.021.087.04.02.01.01.04.07.01.06.0
1750.031.046.018.074.026.05.038.09.08.06.04.017.024.034.026.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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04-0.841-2.407-4.248-2.407-2.953-1.147-4.248-2.4071.5511.76-1.1471.22-2.056-1.796-2.407-1.274
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07-2.9532.684-1.796-1.42-4.248-2.056-4.248-4.248-4.248-2.056-4.248-4.248-2.953-1.034-4.248-2.056
08-2.953-4.248-4.248-2.9532.419-1.59-2.0561.306-4.248-4.248-4.248-1.796-2.407-2.953-4.248-1.42
09-4.248-4.2481.0232.15-4.248-4.248-2.953-1.59-4.248-4.248-4.248-2.056-4.248-4.248-0.211.198
10-4.248-4.248-4.248-4.248-4.248-4.248-4.248-4.248-0.757-2.407-2.9531.1140.497-2.056-1.7962.331
11-1.274-2.0560.52-2.953-4.248-2.407-2.407-2.953-4.248-2.953-1.796-4.248-2.056-1.2742.516-0.54
12-2.407-4.248-4.248-1.147-2.056-4.248-2.953-1.034-2.407-2.056-2.0562.637-2.407-2.407-2.407-0.841
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