We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorNfe2l2
ModelNF2L2_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length17
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusdnbWGCYRASTCAYbbb
Best auROC (human)0.901
Best auROC (mouse)0.99
Peak sets in benchmark (human)5
Peak sets in benchmark (mouse)26
Aligned words104
TF familyJun-related factors {1.1.1}
TF subfamilyNF-E2-like factors {1.1.1.2}
MGIMGI:108420
EntrezGeneGeneID:18024
(SSTAR profile)
UniProt IDNF2L2_MOUSE
UniProt ACQ60795
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 6.85416
0.0005 9.00711
0.0001 13.617910000000002
GTEx tissue expression atlas Nfe2l2 expression
Motifs in JASPAR
MA0150.1 (NFE2L2; Homo sapiens)
MA0150.2 (Nfe2l2; Mus musculus)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0127.05.02.013.03.02.00.06.06.02.03.04.06.05.01.019.0
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034.04.01.05.05.03.00.031.03.02.02.014.02.02.02.024.0
040.00.013.01.02.02.04.03.01.00.03.01.00.01.072.01.0
050.02.01.00.01.02.00.00.00.091.01.00.00.04.02.00.0
061.00.00.00.011.015.02.071.00.04.00.00.00.00.00.00.0
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100.00.00.08.00.00.00.016.00.00.00.079.00.00.00.01.0
110.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.02.0102.00.00.0
122.00.00.00.0101.01.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
130.034.04.065.00.00.00.01.00.00.00.00.00.00.00.00.0
140.00.00.00.08.09.00.017.02.01.01.00.00.018.026.022.0
150.02.07.01.05.09.04.010.03.021.01.02.01.011.021.06.0
162.02.01.04.04.09.02.028.02.09.06.016.03.03.03.010.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
011.391-0.25-1.0870.672-0.725-1.087-3.152-0.076-0.076-1.087-0.725-0.459-0.076-0.25-1.6611.044
020.3130.5930.5930.313-1.087-0.076-3.152-0.076-0.725-0.725-3.152-3.152-3.1520.9910.3130.812
03-0.459-0.459-1.661-0.25-0.25-0.725-3.1521.528-0.725-1.087-1.0870.744-1.087-1.087-1.0871.275
04-3.152-3.1520.672-1.661-1.087-1.087-0.459-0.725-1.661-3.152-0.725-1.661-3.152-1.6612.365-1.661
05-3.152-1.087-1.661-3.152-1.661-1.087-3.152-3.152-3.1522.599-1.661-3.152-3.152-0.459-1.087-3.152
06-1.661-3.152-3.152-3.1520.5080.812-1.0872.351-3.152-0.459-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152
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09-0.0760.7442.308-1.661-1.087-3.152-3.152-3.152-3.152-1.087-0.459-3.152-3.152-3.1520.071-3.152
10-3.152-3.152-3.1520.2-3.152-3.152-3.1520.875-3.152-3.152-3.1522.458-3.152-3.152-3.152-1.661
11-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-1.0872.712-3.152-3.152
12-1.087-3.152-3.152-3.1522.702-1.661-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152
13-3.1521.619-0.4592.263-3.152-3.152-3.152-1.661-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152-3.152
14-3.152-3.152-3.152-3.1520.20.313-3.1520.935-1.087-1.661-1.661-3.152-3.1520.9911.3541.189
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