We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorRest
ModelREST_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length24
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnYCAGSACCdhGGACAGMdSYhnv
Best auROC (human)0.999
Best auROC (mouse)0.998
Peak sets in benchmark (human)147
Peak sets in benchmark (mouse)33
Aligned words332
TF familyFactors with multiple dispersed zinc fingers {2.3.4}
TF subfamilyunclassified {2.3.4.0}
MGIMGI:104897
EntrezGeneGeneID:19712
(SSTAR profile)
UniProt IDREST_MOUSE
UniProt ACQ8VIG1
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -2.42354
0.0005 0.20331
0.0001 5.939959999999999
GTEx tissue expression atlas Rest expression
Motifs in JASPAR
MA0138.1 (REST; Homo sapiens)
MA0138.2 (REST; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.012.08.024.09.018.03.014.00.015.014.047.03.015.03.0147.0
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1914.035.015.05.00.04.01.01.021.087.027.06.07.0105.04.00.0
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2316.020.048.011.029.019.030.013.025.039.029.09.08.011.019.06.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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13-1.837-2.74-4.064-4.064-4.064-4.064-4.064-2.742.6380.012-2.19-1.199-2.74-4.064-2.74-2.74
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