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Model info
Transcription factorTbx20
ModelTBX20_MOUSE.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length14
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusnvSTGnTGACARvn
Best auROC (human)
Best auROC (mouse)0.91
Peak sets in benchmark (human)
Peak sets in benchmark (mouse)4
Aligned words468
TF familyTBX1-related factors {6.5.3}
TF subfamilyTBX20 {6.5.3.0.5}
MGIMGI:1888496
EntrezGeneGeneID:57246
(SSTAR profile)
UniProt IDTBX20_MOUSE
UniProt ACQ9ES03
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 8.531410000000001
0.0005 10.62846
0.0001 14.995815
GTEx tissue expression atlas Tbx20 expression
Motifs in JASPAR
MA0689.1 (TBX20; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0137.013.098.015.026.015.012.026.041.017.061.05.09.016.066.09.0
026.014.093.00.08.026.016.011.02.073.0145.017.02.012.037.04.0
031.01.00.016.018.015.00.092.024.024.02.0241.00.05.00.027.0
046.02.035.00.03.00.039.03.00.00.02.00.07.03.0364.02.0
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067.03.01.0104.04.02.01.0123.01.04.03.086.04.01.020.0102.0
070.00.016.00.01.00.09.00.03.00.022.00.07.01.0407.00.0
0810.01.00.00.01.00.00.00.0445.01.08.00.00.00.00.00.0
0966.0366.021.03.00.02.00.00.00.08.00.00.00.00.00.00.0
1061.00.02.03.0364.00.012.00.017.01.00.03.02.00.01.00.0
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1210.019.033.03.04.02.03.01.052.0134.0135.029.09.07.016.09.0
1312.020.017.026.039.043.04.076.062.045.036.044.09.09.07.017.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.237-0.7911.204-0.651-0.112-0.651-0.868-0.1120.338-0.5290.732-1.701-1.146-0.5880.811-1.146
02-1.531-0.7191.152-4.342-1.258-0.112-0.588-0.952-2.5160.9111.595-0.529-2.516-0.8680.237-1.907
03-3.06-3.06-4.342-0.588-0.473-0.651-4.3421.141-0.191-0.191-2.5162.102-4.342-1.701-4.342-0.075
04-1.531-2.5160.182-4.342-2.166-4.3420.289-2.166-4.342-4.342-2.516-4.342-1.385-2.1662.514-2.516
05-1.701-2.166-1.701-2.166-2.516-2.166-4.342-4.3421.2921.4311.0861.431-3.06-3.06-2.516-3.06
06-1.385-2.166-3.061.263-1.907-2.516-3.061.431-3.06-1.907-2.1661.074-1.907-3.06-0.371.244
07-4.342-4.342-0.588-4.342-3.06-4.342-1.146-4.342-2.166-4.342-0.276-4.342-1.385-3.062.625-4.342
08-1.044-3.06-4.342-4.342-3.06-4.342-4.342-4.3422.714-3.06-1.258-4.342-4.342-4.342-4.342-4.342
090.8112.519-0.322-2.166-4.342-2.516-4.342-4.342-4.342-1.258-4.342-4.342-4.342-4.342-4.342-4.342
100.732-4.342-2.516-2.1662.514-4.342-0.868-4.342-0.529-3.06-4.342-2.166-2.516-4.342-3.06-4.342
110.765-1.1462.4370.182-4.342-4.342-3.06-4.342-3.06-3.06-1.385-1.531-3.06-4.342-1.701-4.342
12-1.044-0.420.123-2.166-1.907-2.516-2.166-3.060.5741.5161.523-0.004-1.146-1.385-0.588-1.146
13-0.868-0.37-0.529-0.1120.2890.385-1.9070.9510.7490.430.2090.408-1.146-1.146-1.385-0.529