Check the newest release v12
Model info
Transcription factorFOXH1
(GeneCards)
ModelFOXH1_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length12
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnTGTGGATTbnv
Best auROC (human)0.982
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)7
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words502
TF familyForkhead box (FOX) factors {3.3.1}
TF subfamilyFOXH {3.3.1.8}
HGNCHGNC:3814
EntrezGeneGeneID:8928
(SSTAR profile)
UniProt IDFOXH1_HUMAN
UniProt ACO75593
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 8.17213
0.0005 10.46657
0.0001 15.287519999999999
GTEx tissue expression atlas FOXH1 expression
ReMap ChIP-seq dataset list FOXH1 datasets
Motifs in JASPAR
MA0479.1 (FOXH1; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
014.09.04.0126.028.03.02.085.04.00.02.083.09.02.018.0120.0
021.00.044.00.00.00.014.00.03.00.023.00.01.00.0413.00.0
030.00.00.05.00.00.00.00.00.08.06.0480.00.00.00.00.0
040.00.00.00.00.00.07.01.00.00.05.01.05.00.0419.061.0
050.00.05.00.00.00.00.00.00.01.0318.0112.00.00.053.010.0
060.00.00.00.01.00.00.00.0357.00.00.019.0118.01.02.01.0
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091.01.00.00.07.012.01.013.00.01.00.01.048.0178.0192.044.0
109.010.033.04.072.067.014.039.047.039.084.023.07.015.032.04.0
1130.027.069.09.087.017.07.020.056.035.056.016.011.08.048.03.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-1.973-1.213-1.9731.387-0.106-2.232-2.5820.995-1.973-4.398-2.5820.971-1.213-2.582-0.5411.338
02-3.124-4.3980.341-4.398-4.398-4.398-0.786-4.398-2.232-4.398-0.3-4.398-3.124-4.3982.572-4.398
03-4.398-4.398-4.398-1.768-4.398-4.398-4.398-4.398-4.398-1.326-1.5982.722-4.398-4.398-4.398-4.398
04-4.398-4.398-4.398-4.398-4.398-4.398-1.452-3.124-4.398-4.398-1.768-3.124-1.768-4.3982.5860.665
05-4.398-4.398-1.768-4.398-4.398-4.398-4.398-4.398-4.398-3.1242.3111.27-4.398-4.3980.525-1.112
06-4.398-4.398-4.398-4.398-3.124-4.398-4.398-4.3982.426-4.398-4.398-0.4881.322-3.124-2.582-3.124
07-0.488-1.326-1.1122.633-4.398-4.398-4.398-3.124-4.398-4.398-3.124-3.124-4.398-4.398-0.858-1.452
08-3.124-3.124-4.398-0.597-4.398-4.398-4.398-1.326-3.124-2.232-4.398-0.437-4.398-0.072-2.5822.582
09-3.124-3.124-4.398-4.398-1.452-0.936-3.124-0.858-4.398-3.124-4.398-3.1240.4271.7321.8070.341
10-1.213-1.1120.056-1.9730.830.758-0.7860.2210.4060.2210.983-0.3-1.452-0.7190.025-1.973
11-0.038-0.1420.787-1.2131.018-0.597-1.452-0.4370.580.1140.58-0.656-1.02-1.3260.427-2.232