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Model info
Transcription factorHSF1
(GeneCards)
ModelHSF1_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length18
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnvbRGAAnnWTCYRGAAn
Best auROC (human)0.997
Best auROC (mouse)0.991
Peak sets in benchmark (human)56
Peak sets in benchmark (mouse)32
Aligned words506
TF familyHSF factors {3.4.1}
TF subfamilyHSF1 (HSTF1) {3.4.1.0.1}
HGNCHGNC:5224
EntrezGeneGeneID:3297
(SSTAR profile)
UniProt IDHSF1_HUMAN
UniProt ACQ00613
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 6.36021
0.0005 8.78671
0.0001 13.92331
GTEx tissue expression atlas HSF1 expression
ReMap ChIP-seq dataset list HSF1 datasets
Motifs in JASPAR
MA0486.1 (HSF1; Homo sapiens)
MA0486.2 (HSF1; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0151.030.018.07.038.059.014.020.033.040.031.014.010.0100.024.011.0
0225.013.038.056.023.063.018.0125.018.028.018.023.05.019.014.014.0
0335.00.036.00.079.06.033.05.046.010.029.03.078.010.0129.01.0
041.01.0236.00.01.00.025.00.01.01.0225.00.00.01.08.00.0
052.00.00.01.02.01.00.00.0474.05.010.05.00.00.00.00.0
06436.08.016.018.04.00.01.01.08.02.00.00.03.01.00.02.0
07122.089.0129.0111.01.03.04.03.01.06.07.03.01.07.05.08.0
0837.031.044.013.035.028.09.033.021.041.063.020.011.019.073.022.0
0912.06.06.080.019.06.01.093.022.016.011.0140.02.05.02.079.0
1010.04.07.034.012.01.00.020.00.01.01.018.018.06.023.0345.0
114.035.00.01.03.09.00.00.01.030.00.00.06.0407.04.00.0
120.04.01.09.03.0171.016.0291.00.02.01.01.01.00.00.00.0
132.00.02.00.0150.010.014.03.011.05.02.00.0142.016.0143.00.0
142.03.0300.00.00.02.029.00.02.00.0159.00.00.00.03.00.0
153.00.01.00.04.01.00.00.0447.06.018.020.00.00.00.00.0
16380.016.042.016.06.00.01.00.07.06.04.02.010.07.02.01.0
17129.080.0121.073.08.09.03.09.022.09.013.05.02.06.07.04.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.485-0.04-0.543-1.4540.1930.63-0.788-0.4390.0540.244-0.008-0.788-1.1141.155-0.26-1.022
02-0.22-0.860.1930.578-0.3020.695-0.5431.377-0.543-0.108-0.543-0.302-1.77-0.49-0.788-0.788
030.112-4.40.14-4.40.92-1.60.054-1.770.383-1.114-0.074-2.2340.907-1.1141.408-3.126
04-3.126-3.1262.011-4.4-3.126-4.4-0.22-4.4-3.126-3.1261.963-4.4-4.4-3.126-1.328-4.4
05-2.584-4.4-4.4-3.126-2.584-3.126-4.4-4.42.708-1.77-1.114-1.77-4.4-4.4-4.4-4.4
062.624-1.328-0.658-0.543-1.975-4.4-3.126-3.126-1.328-2.584-4.4-4.4-2.234-3.126-4.4-2.584
071.3531.0391.4081.259-3.126-2.234-1.975-2.234-3.126-1.6-1.454-2.234-3.126-1.454-1.77-1.328
080.167-0.0080.339-0.860.112-0.108-1.2150.054-0.3920.2690.695-0.439-1.022-0.490.841-0.346
09-0.938-1.6-1.60.932-0.49-1.6-3.1261.082-0.346-0.658-1.0221.49-2.584-1.77-2.5840.92
10-1.114-1.975-1.4540.083-0.938-3.126-4.4-0.439-4.4-3.126-3.126-0.543-0.543-1.6-0.3022.39
11-1.9750.112-4.4-3.126-2.234-1.215-4.4-4.4-3.126-0.04-4.4-4.4-1.62.555-1.975-4.4
12-4.4-1.975-3.126-1.215-2.2341.69-0.6582.22-4.4-2.584-3.126-3.126-3.126-4.4-4.4-4.4
13-2.584-4.4-2.584-4.41.559-1.114-0.788-2.234-1.022-1.77-2.584-4.41.504-0.6581.511-4.4
14-2.584-2.2342.251-4.4-4.4-2.584-0.074-4.4-2.584-4.41.617-4.4-4.4-4.4-2.234-4.4
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