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Model info
Transcription factorIRF3
(GeneCards)
ModelIRF3_HUMAN.H11DI.0.B
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
B
Motif rank
0
ConsensusnvdRRMdRGAAAvnGAAAvndvv
Best auROC (human)0.797
Best auROC (mouse)0.962
Peak sets in benchmark (human)6
Peak sets in benchmark (mouse)21
Aligned words510
TF familyInterferon-regulatory factors {3.5.3}
TF subfamilyIRF-3 {3.5.3.0.3}
HGNCHGNC:6118
EntrezGeneGeneID:3661
(SSTAR profile)
UniProt IDIRF3_HUMAN
UniProt ACQ14653
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
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0.0001 16.42471
GTEx tissue expression atlas IRF3 expression
ReMap ChIP-seq dataset list IRF3 datasets
Motifs in JASPAR
MA1418.1 (IRF3; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0143.031.046.07.035.014.05.014.030.016.044.07.014.017.022.08.0
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PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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