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Model info
Transcription factorZNF146
(GeneCards)
ModelOZF_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length27
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusYCYTTTTYATGGCTGMATARTATTCCA
Best auROC (human)0.992
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words453
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyZNF146-like factors {2.3.3.55}
HGNCHGNC:12931
EntrezGeneGeneID:7705
(SSTAR profile)
UniProt IDOZF_HUMAN
UniProt ACQ15072
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
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0.0001 -9.558589999999999
GTEx tissue expression atlas ZNF146 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF146 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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04-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-1.351-1.012.721
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12-4.313-1.224-4.313-3.027-4.313-3.027-4.313-4.313-4.3132.684-1.351-0.554-4.313-4.313-4.313-4.313
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