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Model info
Transcription factorZNF436
(GeneCards)
ModelZN436_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length27
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusRKCMdGGARGRCTTCCTGGAGGAGGhG
Best auROC (human)0.984
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words485
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyZNF180-like factors {2.3.3.58}
HGNCHGNC:20814
EntrezGeneGeneID:80818
(SSTAR profile)
UniProt IDZN436_HUMAN
UniProt ACQ9C0F3
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -12.96254
0.0005 -9.53949
0.0001 -2.08659
GTEx tissue expression atlas ZNF436 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF436 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0116.025.035.0215.02.03.00.07.07.06.020.0120.02.04.02.021.0
022.09.01.015.00.033.00.05.05.033.05.014.03.0339.012.09.0
033.04.01.02.0242.0113.03.056.09.08.01.00.04.030.08.01.0
0457.014.0169.018.075.028.011.041.03.01.05.04.011.04.040.04.0
057.01.0138.00.013.05.020.09.020.01.0202.02.02.02.062.01.0
062.00.040.00.01.01.07.00.09.00.0411.02.00.00.012.00.0
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110.081.00.00.00.029.00.00.00.0367.00.00.00.08.00.00.0
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160.06.04.026.014.033.02.0359.00.02.00.03.02.09.03.022.0
171.00.015.00.018.00.021.011.01.00.07.01.05.00.0404.01.0
181.00.024.00.00.00.00.00.015.07.0414.011.00.00.012.01.0
1913.00.01.02.07.00.00.00.0430.02.07.011.012.00.00.00.0
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211.00.055.01.00.00.00.00.04.01.0423.00.00.00.00.00.0
225.00.00.00.00.00.00.01.0435.017.06.020.01.00.00.00.0
2369.00.0372.00.06.00.011.00.01.00.05.00.00.00.021.00.0
242.00.074.00.00.00.00.00.011.01.0391.06.00.00.00.00.0
250.01.07.05.00.00.00.01.078.0104.022.0261.02.01.01.02.0
2611.04.065.00.061.08.035.02.06.02.022.00.011.04.0251.03.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.628-0.190.1421.948-2.554-2.204-4.375-1.425-1.425-1.57-0.4091.366-2.554-1.946-2.554-0.361
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040.626-0.7581.708-0.5130.898-0.078-0.9920.299-2.204-3.097-1.74-1.946-0.992-1.9460.274-1.946
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10-3.097-2.554-0.628-4.375-3.097-4.375-2.554-4.3750.95-0.1512.429-1.298-4.375-3.097-3.097-4.375
11-4.3750.975-4.375-4.375-4.375-0.044-4.375-4.375-4.3752.482-4.375-4.375-4.375-1.298-4.375-4.375
12-4.375-4.375-4.375-4.375-1.084-0.908-1.742.703-4.375-4.375-4.375-4.375-4.375-4.375-4.375-4.375
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14-4.375-1.74-4.375-4.375-4.375-0.114-4.375-4.375-4.3750.274-3.097-3.097-4.3752.576-3.097-1.425
15-4.375-4.375-4.375-4.3750.1132.571-1.740.142-3.097-3.097-4.375-4.375-3.097-1.57-4.375-3.097
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200.572-4.3752.588-4.375-3.097-4.375-3.097-4.375-2.554-4.375-1.57-4.375-4.375-4.375-0.83-4.375
21-3.097-4.3750.59-3.097-4.375-4.375-4.375-4.375-1.946-3.0972.624-4.375-4.375-4.375-4.375-4.375
22-1.74-4.375-4.375-4.375-4.375-4.375-4.375-3.0972.652-0.569-1.57-0.409-3.097-4.375-4.375-4.375
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24-2.554-4.3750.885-4.375-4.375-4.375-4.375-4.375-0.992-3.0972.545-1.57-4.375-4.375-4.375-4.375
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