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Model info
Transcription factorBACH2
(GeneCards)
ModelBACH2_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length14
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusdhnWGCTGASTCAb
Best auROC (human)0.938
Best auROC (mouse)0.988
Peak sets in benchmark (human)10
Peak sets in benchmark (mouse)3
Aligned words506
TF familyJun-related factors {1.1.1}
TF subfamilyNF-E2-like factors {1.1.1.2}
HGNCHGNC:14078
EntrezGeneGeneID:60468
(SSTAR profile)
UniProt IDBACH2_HUMAN
UniProt ACQ9BYV9
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 8.297360000000001
0.0005 10.300460000000001
0.0001 14.51507
GTEx tissue expression atlas BACH2 expression
ReMap ChIP-seq dataset list BACH2 datasets
Motifs in JASPAR
MA1101.1 (BACH2; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01141.028.024.045.020.03.08.027.026.014.016.019.019.020.015.075.0
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1326.0139.098.0220.04.01.02.04.00.01.01.02.01.00.01.00.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
011.497-0.108-0.260.361-0.439-2.234-1.328-0.144-0.181-0.788-0.658-0.49-0.49-0.439-0.7210.868
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06-4.4-2.234-3.126-0.04-0.108-0.346-2.5842.533-3.126-4.4-4.4-1.975-2.584-3.126-4.4-1.328
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10-4.4-4.4-4.40.112-2.234-4.4-4.40.993-4.4-1.6-2.2342.384-4.4-4.4-4.4-0.22
11-3.126-3.126-3.126-4.4-2.584-1.975-4.4-4.4-4.4-2.234-4.4-4.40.1932.645-2.234-2.584
120.269-4.4-4.4-4.42.633-1.215-2.234-3.126-3.126-2.584-3.126-4.4-3.126-4.4-4.4-3.126
13-0.1811.4831.1351.941-1.975-3.126-2.584-1.975-4.4-3.126-3.126-2.584-3.126-4.4-3.126-4.4