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Model info
Transcription factorDMRT1
(GeneCards)
ModelDMRT1_HUMAN.H11DI.0.D
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length19
Quality
D
Motif rank
0
ConsensusnhdGhhACAAWGTWdChdn
Best auROC (human)0.567
Best auROC (mouse)0.988
Peak sets in benchmark (human)2
Peak sets in benchmark (mouse)4
Aligned words541
TF familyDMRT {2.5.1}
TF subfamilyDMRT1 {2.5.1.0.1}
HGNCHGNC:2934
EntrezGeneGeneID:1761
(SSTAR profile)
UniProt IDDMRT1_HUMAN
UniProt ACQ9Y5R6
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 7.2473600000000005
0.0005 9.56046
0.0001 14.46256
GTEx tissue expression atlas DMRT1 expression
ReMap ChIP-seq dataset list DMRT1 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0144.049.029.057.019.022.02.036.021.014.04.054.015.031.022.072.0
0241.06.027.025.052.07.04.053.022.03.014.018.045.09.083.082.0
0314.09.0133.04.03.01.017.04.08.06.0109.05.08.04.0164.02.0
0418.03.03.09.09.05.02.04.0170.0148.014.091.06.04.02.03.0
0562.025.023.093.074.014.02.070.09.05.01.06.028.07.06.066.0
06170.01.01.01.050.00.01.00.029.01.00.02.0230.01.01.03.0
078.0457.06.08.01.02.00.00.00.03.00.00.00.05.00.01.0
089.00.00.00.0412.04.00.051.04.00.00.02.02.00.01.06.0
09338.089.00.00.03.01.00.00.01.00.00.00.045.014.00.00.0
10131.02.07.0247.020.01.01.082.00.00.00.00.00.00.00.00.0
112.04.0144.01.00.00.03.00.01.01.06.00.03.01.0325.00.0
121.00.00.05.00.00.00.06.015.00.02.0461.00.00.00.01.0
1311.02.00.03.00.00.00.00.02.00.00.00.0247.018.045.0163.0
1483.01.094.082.02.01.02.015.015.01.017.012.038.07.076.045.0
153.0120.08.07.01.09.00.00.00.0181.04.04.02.0141.03.08.0
162.02.00.02.0213.0105.014.0119.07.04.02.02.07.06.02.04.0
17109.039.051.030.086.012.00.019.05.05.04.04.034.024.039.030.0
1878.042.057.057.024.019.03.034.018.021.019.036.010.020.014.039.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.3570.463-0.0560.613-0.472-0.328-2.5660.158-0.374-0.77-1.9580.56-0.7030.01-0.3280.846
020.287-1.582-0.126-0.2020.522-1.437-1.9580.541-0.328-2.216-0.77-0.5250.379-1.1970.9870.975
03-0.77-1.1971.457-1.958-2.216-3.109-0.581-1.958-1.31-1.5821.258-1.752-1.31-1.9581.666-2.566
04-0.525-2.216-2.216-1.197-1.197-1.752-2.566-1.9581.7021.563-0.771.079-1.582-1.958-2.566-2.216
050.697-0.202-0.2841.10.873-0.77-2.5660.818-1.197-1.752-3.109-1.582-0.09-1.437-1.5820.759
061.702-3.109-3.109-3.1090.483-4.385-3.109-4.385-0.056-3.109-4.385-2.5662.003-3.109-3.109-2.216
07-1.312.689-1.582-1.31-3.109-2.566-4.385-4.385-4.385-2.216-4.385-4.385-4.385-1.752-4.385-3.109
08-1.197-4.385-4.385-4.3852.586-1.958-4.3850.503-1.958-4.385-4.385-2.566-2.566-4.385-3.109-1.582
092.3881.057-4.385-4.385-2.216-3.109-4.385-4.385-3.109-4.385-4.385-4.3850.379-0.77-4.385-4.385
101.442-2.566-1.4372.075-0.421-3.109-3.1090.975-4.385-4.385-4.385-4.385-4.385-4.385-4.385-4.385
11-2.566-1.9581.536-3.109-4.385-4.385-2.216-4.385-3.109-3.109-1.582-4.385-2.216-3.1092.349-4.385
12-3.109-4.385-4.385-1.752-4.385-4.385-4.385-1.582-0.703-4.385-2.5662.698-4.385-4.385-4.385-3.109
13-1.004-2.566-4.385-2.216-4.385-4.385-4.385-4.385-2.566-4.385-4.385-4.3852.075-0.5250.3791.66
140.987-3.1091.1110.975-2.566-3.109-2.566-0.703-0.703-3.109-0.581-0.920.211-1.4370.8990.379
15-2.2161.354-1.31-1.437-3.109-1.197-4.385-4.385-4.3851.764-1.958-1.958-2.5661.515-2.216-1.31
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171.2580.2370.503-0.0221.022-0.92-4.385-0.472-1.752-1.752-1.958-1.9580.101-0.2420.237-0.022
180.9250.310.6130.613-0.242-0.472-2.2160.101-0.525-0.374-0.4720.158-1.096-0.421-0.770.237