We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorDmrt1
ModelDMRT1_MOUSE.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length19
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusnhdGhhACAAWGTWdChdn
Best auROC (human)0.567
Best auROC (mouse)0.988
Peak sets in benchmark (human)2
Peak sets in benchmark (mouse)4
Aligned words541
TF familyDMRT {2.5.1}
TF subfamilyDMRT1 {2.5.1.0.1}
MGIMGI:1354733
EntrezGeneGeneID:50796
(SSTAR profile)
UniProt IDDMRT1_MOUSE
UniProt ACQ9QZ59
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 7.337860000000001
0.0005 9.65726
0.0001 14.58676
GTEx tissue expression atlas Dmrt1 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0144.049.029.057.019.022.02.036.021.014.04.054.015.031.022.072.0
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153.0120.08.07.01.09.00.00.00.0181.04.04.02.0141.03.08.0
162.02.00.02.0213.0105.014.0119.07.04.02.02.07.06.02.04.0
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1878.042.057.057.024.019.03.034.018.021.019.036.010.020.014.039.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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03-0.77-1.1971.457-1.958-2.216-3.109-0.581-1.958-1.31-1.5821.258-1.752-1.31-1.9581.666-2.566
04-0.525-2.216-2.216-1.197-1.197-1.752-2.566-1.9581.7021.563-0.771.079-1.582-1.958-2.566-2.216
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08-1.197-4.385-4.385-4.3852.586-1.958-4.3850.503-1.958-4.385-4.385-2.566-2.566-4.385-3.109-1.582
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11-2.566-1.9581.536-3.109-4.385-4.385-2.216-4.385-3.109-3.109-1.582-4.385-2.216-3.1092.349-4.385
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13-1.004-2.566-4.385-2.216-4.385-4.385-4.385-4.385-2.566-4.385-4.385-4.3852.075-0.5250.3791.66
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