We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorDUX4
(GeneCards)
ModelDUX4_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length14
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusKWTGATTASATTCd
Best auROC (human)0.971
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)5
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words367
TF familyPaired-related HD factors {3.1.3}
TF subfamilyDUX {3.1.3.7}
HGNCHGNC:50800
EntrezGeneGeneID:100288687
(SSTAR profile)
UniProt IDDUX4_HUMAN
UniProt ACQ9UBX2
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -1.99445
0.0005 0.95102
0.0001 7.4177599999999995
GTEx tissue expression atlas DUX4 expression
ReMap ChIP-seq dataset list DUX4 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
017.02.06.05.015.01.00.012.0139.03.010.02.010.01.010.010.0
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PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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03-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.7782.751-3.778
04-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.7782.751-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778
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11-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.7782.751
12-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.7781.9652.145-3.778-3.778
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