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Model info
Transcription factorDUX4
(GeneCards)
ModelDUX4_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length14
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusKWTGATTASATTCd
Best auROC (human)0.971
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)5
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words367
TF familyPaired-related HD factors {3.1.3}
TF subfamilyDUX {3.1.3.7}
HGNCHGNC:50800
EntrezGeneGeneID:100288687
(SSTAR profile)
UniProt IDDUX4_HUMAN
UniProt ACQ9UBX2
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -1.99445
0.0005 0.95102
0.0001 7.4177599999999995
GTEx tissue expression atlas DUX4 expression
ReMap ChIP-seq dataset list DUX4 datasets
Motifs in JASPAR
MA0468.1 (DUX4; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
017.02.06.05.015.01.00.012.0139.03.010.02.010.01.010.010.0
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PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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10-3.778-3.778-3.7782.161-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.7781.946-3.778-3.778-3.778-3.778
11-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.7782.751
12-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.7781.9652.145-3.778-3.778
130.7110.151-0.8551.275-3.778-3.7782.145-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778-3.778