Check the newest release v13
Model info
Transcription factorE2F6
(GeneCards)
ModelE2F6_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length12
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnvRGMGGGARvv
Best auROC (human)0.896
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)17
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words502
TF familyE2F-related factors {3.3.2}
TF subfamilyE2F {3.3.2.1}
HGNCHGNC:3120
EntrezGeneGeneID:1876
(SSTAR profile)
UniProt IDE2F6_HUMAN
UniProt ACO75461
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 8.258420000000001
0.0005 10.257405
0.0001 14.24863
GTEx tissue expression atlas E2F6 expression
ReMap ChIP-seq dataset list E2F6 datasets
Motifs in JASPAR
MA0471.1 (E2F6; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0144.016.067.02.032.011.043.023.066.044.063.011.012.07.035.023.0
0234.019.0100.01.020.011.047.00.066.043.093.06.05.02.050.02.0
034.05.0114.02.02.01.070.02.07.013.0263.07.01.00.07.01.0
042.09.00.03.00.09.00.010.094.0319.04.037.05.05.00.02.0
0511.00.082.08.033.01.0286.022.00.00.03.01.02.01.048.01.0
061.01.044.00.00.01.01.00.010.06.0403.00.02.00.030.00.0
070.00.013.00.00.00.08.00.02.01.0475.00.00.00.00.00.0
082.00.00.00.01.00.00.00.0492.03.01.00.00.00.00.00.0
09311.011.0169.04.01.00.02.00.01.00.00.00.00.00.00.00.0
10131.036.0117.029.01.05.03.02.057.031.061.022.00.00.02.02.0
1161.043.073.012.013.019.032.08.045.050.063.025.09.014.018.014.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.341-0.6560.758-2.5820.025-1.020.318-0.30.7430.3410.697-1.02-0.936-1.4520.114-0.3
020.085-0.4881.157-3.124-0.437-1.020.406-4.3980.7430.3181.084-1.598-1.768-2.5820.467-2.582
03-1.973-1.7681.287-2.582-2.582-3.1240.802-2.582-1.452-0.8582.121-1.452-3.124-4.398-1.452-3.124
04-2.582-1.213-4.398-2.232-4.398-1.213-4.398-1.1121.0952.314-1.9730.169-1.768-1.768-4.398-2.582
05-1.02-4.3980.959-1.3260.056-3.1242.205-0.344-4.398-4.398-2.232-3.124-2.582-3.1240.427-3.124
06-3.124-3.1240.341-4.398-4.398-3.124-3.124-4.398-1.112-1.5982.548-4.398-2.582-4.398-0.038-4.398
07-4.398-4.398-0.858-4.398-4.398-4.398-1.326-4.398-2.582-3.1242.712-4.398-4.398-4.398-4.398-4.398
08-2.582-4.398-4.398-4.398-3.124-4.398-4.398-4.3982.747-2.232-3.124-4.398-4.398-4.398-4.398-4.398
092.289-1.021.68-1.973-3.124-4.398-2.582-4.398-3.124-4.398-4.398-4.398-4.398-4.398-4.398-4.398
101.4260.1421.313-0.072-3.124-1.768-2.232-2.5820.597-0.0060.665-0.344-4.398-4.398-2.582-2.582
110.6650.3180.843-0.936-0.858-0.4880.025-1.3260.3630.4670.697-0.218-1.213-0.786-0.541-0.786