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Model info
Transcription factorEGR1
(GeneCards)
ModelEGR1_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length21
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnvbGYGKGGGYGGRRvbvbvv
Best auROC (human)0.991
Best auROC (mouse)0.986
Peak sets in benchmark (human)36
Peak sets in benchmark (mouse)12
Aligned words526
TF familyThree-zinc finger Krüppel-related factors {2.3.1}
TF subfamilyEGR factors {2.3.1.3}
HGNCHGNC:3238
EntrezGeneGeneID:1958
(SSTAR profile)
UniProt IDEGR1_HUMAN
UniProt ACP18146
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -0.33919
0.0005 2.2961599999999995
0.0001 7.9851600000000005
GTEx tissue expression atlas EGR1 expression
ReMap ChIP-seq dataset list EGR1 datasets
Motifs in JASPAR
MA0162.1 (Egr1; Mus musculus)
MA0162.2 (EGR1; Homo sapiens)
MA0162.3 (EGR1; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0122.017.050.08.026.020.041.014.060.035.085.014.05.019.059.015.0
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044.012.02.07.03.010.00.06.065.0294.03.073.02.06.00.03.0
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1613.023.047.012.014.061.054.034.036.048.065.030.04.019.020.010.0
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2025.010.050.09.021.017.029.020.048.053.0108.033.04.016.028.019.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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10-4.383-4.383-4.383-4.383-4.383-4.383-4.383-4.3830.8482.277-4.3831.323-4.383-4.383-4.383-4.383
11-3.107-4.3830.834-4.383-4.383-1.9562.261-3.107-4.383-4.383-4.383-4.383-3.107-4.3831.314-4.383
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