Check the newest release v12
Model info
Transcription factorELF5
(GeneCards)
ModelELF5_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length19
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnvvRSvAvvAGGAAGhdvn
Best auROC (human)0.982
Best auROC (mouse)0.926
Peak sets in benchmark (human)3
Peak sets in benchmark (mouse)12
Aligned words514
TF familyEts-related factors {3.5.2}
TF subfamilyEHF-like factors {3.5.2.4}
HGNCHGNC:3320
EntrezGeneGeneID:2001
(SSTAR profile)
UniProt IDELF5_HUMAN
UniProt ACQ9UKW6
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 7.86796
0.0005 10.37951
0.0001 15.49691
GTEx tissue expression atlas ELF5 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ELF5 datasets
Motifs in JASPAR
MA0136.1 (ELF5; Mus musculus)
MA0136.2 (ELF5; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0163.015.076.013.032.026.022.015.055.025.048.011.019.020.046.012.0
0271.030.061.07.045.018.05.018.086.026.072.08.07.02.032.010.0
0332.012.0158.07.035.05.018.018.063.019.078.010.09.04.025.05.0
0413.017.0107.02.06.013.013.08.032.030.0205.012.09.06.021.04.0
0526.016.015.03.032.024.05.05.0203.037.093.013.012.06.04.04.0
06242.03.024.04.071.01.03.08.0103.02.07.05.020.00.03.02.0
0794.088.0225.029.04.01.01.00.09.04.023.01.03.06.08.02.0
0816.027.064.03.052.030.013.04.086.047.0113.011.012.05.014.01.0
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100.00.0443.03.02.00.09.03.00.00.036.01.00.00.01.00.0
110.00.02.00.00.00.00.00.02.02.0485.00.00.00.07.00.0
122.00.00.00.01.00.01.00.0494.00.00.00.00.00.00.00.0
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1476.024.0386.03.02.00.00.00.00.00.01.00.04.00.02.00.0
1523.024.09.026.09.07.02.06.0151.068.054.0116.00.01.00.02.0
1663.015.097.08.047.011.017.025.030.04.022.09.033.024.061.032.0
1756.016.086.015.024.016.07.07.057.023.092.025.012.021.023.018.0
1846.026.062.015.025.023.06.022.087.032.064.025.011.016.019.019.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.699-0.7170.885-0.8560.027-0.177-0.342-0.7170.564-0.2160.429-1.018-0.486-0.4350.387-0.934
020.818-0.0360.667-1.4510.365-0.539-1.766-0.5391.008-0.1770.832-1.324-1.451-2.580.027-1.11
030.027-0.9341.615-1.4510.116-1.766-0.539-0.5390.699-0.4860.911-1.11-1.211-1.971-0.216-1.766
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10-4.397-4.3972.644-2.23-2.58-4.397-1.211-2.23-4.397-4.3970.144-3.122-4.397-4.397-3.122-4.397
11-4.397-4.397-2.58-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-2.58-2.582.735-4.397-4.397-4.397-1.451-4.397
12-2.58-4.397-4.397-4.397-3.122-4.397-3.122-4.3972.753-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397
132.741-2.58-3.122-1.596-4.397-4.397-4.397-4.397-3.122-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397
140.885-0.2562.506-2.23-2.58-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-3.122-4.397-1.971-4.397-2.58-4.397
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