We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorEsrrg
ModelERR3_MOUSE.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length12
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusnbCAAGGWSAbn
Best auROC (human)
Best auROC (mouse)0.86
Peak sets in benchmark (human)
Peak sets in benchmark (mouse)2
Aligned words258
TF familySteroid hormone receptors (NR3) {2.1.1}
TF subfamilyER-like receptors (NR3A&B) {2.1.1.2}
MGIMGI:1347056
EntrezGeneGeneID:26381
(SSTAR profile)
UniProt IDERR3_MOUSE
UniProt ACP62509
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 9.492615
0.0005 11.239899999999999
0.0001 15.61506
GTEx tissue expression atlas Esrrg expression
Motifs in JASPAR
MA0643.1 (Esrrg; Mus musculus)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
014.08.019.010.010.018.05.034.04.020.018.031.04.012.013.031.0
021.016.05.00.05.052.01.00.01.038.015.01.02.074.030.00.0
034.04.01.00.0178.01.00.01.048.00.02.01.01.00.00.00.0
04225.03.01.02.05.00.00.00.03.00.00.00.01.00.01.00.0
057.00.0225.02.01.00.01.01.00.00.02.00.00.00.02.00.0
060.02.05.01.00.00.00.00.02.03.0222.03.00.02.01.00.0
070.00.00.02.05.00.00.02.041.010.041.0136.03.00.00.01.0
082.034.012.01.00.07.02.01.01.038.00.02.00.0105.027.09.0
093.00.00.00.0160.07.014.03.034.02.04.01.012.01.00.00.0
1016.0110.053.030.00.07.01.02.02.012.03.01.00.01.00.03.0
1111.00.07.00.033.052.023.022.019.017.014.07.06.06.08.016.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-1.266-0.6130.228-0.398-0.3980.175-1.0590.802-1.2660.2780.1750.71-1.266-0.222-0.1440.71
02-2.440.059-1.059-3.805-1.0591.223-2.44-3.805-2.440.912-0.004-2.44-1.8831.5740.678-3.805
03-1.266-1.266-2.44-3.8052.449-2.44-3.805-2.441.144-3.805-1.883-2.44-2.44-3.805-3.805-3.805
042.683-1.528-2.44-1.883-1.059-3.805-3.805-3.805-1.528-3.805-3.805-3.805-2.44-3.805-2.44-3.805
05-0.741-3.8052.683-1.883-2.44-3.805-2.44-2.44-3.805-3.805-1.883-3.805-3.805-3.805-1.883-3.805
06-3.805-1.883-1.059-2.44-3.805-3.805-3.805-3.805-1.883-1.5282.67-1.528-3.805-1.883-2.44-3.805
07-3.805-3.805-3.805-1.883-1.059-3.805-3.805-1.8830.987-0.3980.9872.18-1.528-3.805-3.805-2.44
08-1.8830.802-0.222-2.44-3.805-0.741-1.883-2.44-2.440.912-3.805-1.883-3.8051.9230.574-0.5
09-1.528-3.805-3.805-3.8052.343-0.741-0.071-1.5280.802-1.883-1.266-2.44-0.222-2.44-3.805-3.805
100.0591.9691.2420.678-3.805-0.741-2.44-1.883-1.883-0.222-1.528-2.44-3.805-2.44-3.805-1.528
11-0.306-3.805-0.741-3.8050.7721.2230.4160.3720.2280.118-0.071-0.741-0.887-0.887-0.6130.059