We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorEsr2
ModelESR2_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length20
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnbbnRGGYCRShvTGhCCYn
Best auROC (human)0.926
Best auROC (mouse)0.943
Peak sets in benchmark (human)11
Peak sets in benchmark (mouse)7
Aligned words223
TF familySteroid hormone receptors (NR3) {2.1.1}
TF subfamilyER-like receptors (NR3A&B) {2.1.1.2}
MGIMGI:109392
EntrezGeneGeneID:13983
(SSTAR profile)
UniProt IDESR2_MOUSE
UniProt ACO08537
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 5.97616
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0.0001 12.59191
GTEx tissue expression atlas Esr2 expression
Motifs in JASPAR
MA0258.1 (ESR2; Homo sapiens)
MA0258.2 (ESR2; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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