Check the newest release v13
Model info
Transcription factorETS1
(GeneCards)
ModelETS1_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length15
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusvvvRSMGGAAGYRRn
Best auROC (human)0.966
Best auROC (mouse)0.94
Peak sets in benchmark (human)45
Peak sets in benchmark (mouse)33
Aligned words502
TF familyEts-related factors {3.5.2}
TF subfamilyEts-like factors {3.5.2.1}
HGNCHGNC:3488
EntrezGeneGeneID:2113
(SSTAR profile)
UniProt IDETS1_HUMAN
UniProt ACP14921
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 6.81691
0.0005 9.433810000000001
0.0001 14.24046
GTEx tissue expression atlas ETS1 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ETS1 datasets
Motifs in JASPAR
MA0098.1 (ETS1; Homo sapiens)
MA0098.2 (Ets1; Mus musculus)
MA0098.3 (ETS1; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0146.019.041.06.044.029.028.024.078.025.073.017.015.019.023.011.0
0262.036.075.010.013.028.034.017.046.031.075.013.09.08.032.09.0
0369.07.053.01.062.010.027.04.090.012.0108.06.013.011.023.02.0
0426.0161.046.01.01.034.05.00.019.0133.055.04.01.08.04.00.0
0536.011.00.00.0203.0125.08.00.052.056.02.00.04.01.00.00.0
060.00.0295.00.01.00.0192.00.00.00.08.02.00.00.00.00.0
070.00.01.00.00.00.00.00.01.00.0494.00.00.00.02.00.0
081.00.00.00.00.00.00.00.0491.03.00.03.00.00.00.00.0
09400.03.02.087.03.00.00.00.00.00.00.00.03.00.00.00.0
1091.02.0312.01.00.00.03.00.01.01.00.00.08.00.078.01.0
116.026.04.064.00.02.00.01.025.078.014.0276.01.00.01.00.0
127.03.021.01.022.011.051.022.06.01.09.03.031.028.0251.031.0
1311.010.039.06.012.010.09.012.042.036.0228.026.07.012.034.04.0
148.027.031.06.012.016.018.022.058.074.094.084.04.020.018.06.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.387-0.4860.273-1.5960.343-0.07-0.104-0.2560.911-0.2160.845-0.595-0.717-0.486-0.298-1.018
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030.789-1.4510.527-3.1220.683-1.11-0.14-1.9711.054-0.9341.235-1.596-0.856-1.018-0.298-2.58
04-0.1771.6330.387-3.122-3.1220.087-1.766-4.397-0.4861.4430.564-1.971-3.122-1.324-1.971-4.397
050.144-1.018-4.397-4.3971.8651.381-1.324-4.3970.5080.582-2.58-4.397-1.971-3.122-4.397-4.397
06-4.397-4.3972.238-4.397-3.122-4.3971.809-4.397-4.397-4.397-1.324-2.58-4.397-4.397-4.397-4.397
07-4.397-4.397-3.122-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-3.122-4.3972.753-4.397-4.397-4.397-2.58-4.397
08-3.122-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-4.3972.747-2.23-4.397-2.23-4.397-4.397-4.397-4.397
092.542-2.23-2.581.02-2.23-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-4.397-2.23-4.397-4.397-4.397
101.065-2.582.294-3.122-4.397-4.397-2.23-4.397-3.122-3.122-4.397-4.397-1.324-4.3970.911-3.122
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12-1.451-2.23-0.388-3.122-0.342-1.0180.489-0.342-1.596-3.122-1.211-2.23-0.004-0.1042.077-0.004
13-1.018-1.110.223-1.596-0.934-1.11-1.211-0.9340.2960.1441.981-0.177-1.451-0.9340.087-1.971
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