Check the newest release v12
Model info
Transcription factorETV1
(GeneCards)
ModelETV1_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length12
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusvdCCGGAAGbdv
Best auROC (human)0.95
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)8
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words499
TF familyEts-related factors {3.5.2}
TF subfamilyElk-like factors {3.5.2.2}
HGNCHGNC:3490
EntrezGeneGeneID:2115
(SSTAR profile)
UniProt IDETV1_HUMAN
UniProt ACP50549
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 6.1508899999999995
0.0005 8.641595
0.0001 13.38379
GTEx tissue expression atlas ETV1 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ETV1 datasets
Motifs in JASPAR
MA0761.1 (ETV1; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0138.01.032.08.045.022.025.038.077.027.0107.014.012.09.027.010.0
027.0141.024.00.02.057.00.00.09.0155.027.00.01.065.04.00.0
034.012.00.03.094.0323.00.01.015.040.00.00.00.00.00.00.0
041.00.0112.00.01.00.0374.00.00.00.00.00.00.00.04.00.0
050.00.02.00.00.00.00.00.00.00.0490.00.00.00.00.00.0
060.00.00.00.00.00.00.00.0491.00.01.00.00.00.00.00.0
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101.01.029.02.028.022.062.024.033.014.017.03.032.029.0153.042.0
1131.014.039.010.011.019.027.09.067.083.082.029.07.024.028.012.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.209-3.1110.039-1.3120.377-0.33-0.2040.2090.91-0.1281.238-0.772-0.922-1.199-0.128-1.098
02-1.4391.513-0.244-4.387-2.5680.611-4.387-4.387-1.1991.608-0.128-4.387-3.1110.742-1.96-4.387
03-1.96-0.922-4.387-2.2181.1092.34-4.387-3.111-0.7050.26-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387
04-3.111-4.3871.284-4.387-3.111-4.3872.487-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-1.96-4.387
05-4.387-4.387-2.568-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.3872.757-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387
06-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.3872.759-4.387-3.111-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387
072.663-4.387-3.1110.355-4.387-4.387-4.387-4.387-3.111-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387
080.008-0.332.534-2.568-4.387-4.387-4.387-4.387-3.111-4.387-4.387-4.387-1.584-3.1110.183-4.387
09-2.218-1.199-1.96-0.33-3.111-1.96-3.111-0.583-0.0581.3690.6951.939-4.387-3.111-4.387-3.111
10-3.111-3.111-0.058-2.568-0.092-0.330.695-0.2440.07-0.772-0.583-2.2180.039-0.0581.5950.308
110.008-0.7720.235-1.098-1.006-0.474-0.128-1.1990.7720.9850.973-0.058-1.439-0.244-0.092-0.922