We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorNr3c1
ModelGCR_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length21
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnvvnvRGvACAvRvWGTnMhn
Best auROC (human)0.983
Best auROC (mouse)0.988
Peak sets in benchmark (human)143
Peak sets in benchmark (mouse)119
Aligned words747
TF familySteroid hormone receptors (NR3) {2.1.1}
TF subfamilyGR-like receptors (NR3C) {2.1.1.1}
MGIMGI:95824
EntrezGene
UniProt IDGCR_MOUSE
UniProt ACP06537
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 7.96636
0.0005 10.18401
0.0001 14.76276
GTEx tissue expression atlas Nr3c1 expression
Motifs in JASPAR
MA0113.1 (NR3C1; Mus musculus/Rattus norvegicus/Oncorhynchus mykiss/Gallus gallus/Homo sapiens)
MA0113.2 (NR3C1; Mus musculus)
MA0113.3 (NR3C1; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0119.06.089.09.023.020.08.017.022.09.035.07.023.08.033.07.0
0221.031.030.05.024.012.02.05.069.047.028.021.09.015.010.06.0
0326.021.063.013.033.037.03.032.023.018.014.015.05.017.05.010.0
0429.023.030.05.033.029.05.026.052.011.015.07.015.012.036.07.0
0532.01.092.04.065.00.04.06.029.01.055.01.016.01.028.00.0
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0710.02.045.03.02.00.00.00.0105.037.0101.021.02.02.02.03.0
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100.00.00.00.0268.04.01.024.038.00.00.00.00.00.00.00.0
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1236.02.012.01.066.07.09.05.0111.020.032.08.05.02.016.03.0
1372.040.0102.04.012.07.05.07.026.016.025.02.02.06.08.01.0
1419.017.02.074.016.05.03.045.057.010.04.069.04.01.01.08.0
150.00.096.00.01.00.031.01.00.01.09.00.00.02.0194.00.0
160.00.00.01.00.00.00.03.057.05.08.0260.00.00.01.00.0
174.05.042.06.01.02.00.02.01.03.03.02.057.089.041.077.0
182.053.02.06.07.080.01.011.035.047.02.02.01.080.01.05.0
192.06.034.03.055.064.012.0129.01.01.03.01.01.014.02.07.0
2014.010.022.013.036.018.06.025.037.04.07.03.020.033.062.025.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.095-1.2081.434-0.8220.092-0.045-0.935-0.2040.049-0.8220.507-1.0620.092-0.9350.449-1.062
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040.3210.0920.354-1.3790.4490.321-1.3790.2130.899-0.628-0.327-1.062-0.327-0.5440.535-1.062
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10-4.071-4.071-4.071-4.0712.534-1.586-2.7490.1340.588-4.071-4.071-4.071-4.071-4.071-4.071-4.071
110.841.292.0060.049-4.071-2.199-4.071-2.199-4.071-4.071-2.749-4.071-2.199-0.935-0.544-2.199
120.535-2.199-0.544-2.7491.136-1.062-0.822-1.3791.654-0.0450.418-0.935-1.379-2.199-0.264-1.846
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14-0.095-0.204-2.1991.25-0.264-1.379-1.8460.7560.991-0.72-1.5861.181-1.586-2.749-2.749-0.935
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16-4.071-4.071-4.071-2.749-4.071-4.071-4.071-1.8460.991-1.379-0.9352.503-4.071-4.071-2.749-4.071
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