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Model info
Transcription factorNr3c1
ModelGCR_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length21
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnvvnvRGvACAvRvWGTnMhn
Best auROC (human)0.983
Best auROC (mouse)0.988
Peak sets in benchmark (human)143
Peak sets in benchmark (mouse)119
Aligned words747
TF familySteroid hormone receptors (NR3) {2.1.1}
TF subfamilyGR-like receptors (NR3C) {2.1.1.1}
MGIMGI:95824
EntrezGene
UniProt IDGCR_MOUSE
UniProt ACP06537
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 7.96636
0.0005 10.18401
0.0001 14.76276
GTEx tissue expression atlas Nr3c1 expression
Motifs in JASPAR
MA0113.1 (NR3C1; Mus musculus/Rattus norvegicus/Oncorhynchus mykiss/Gallus gallus/Homo sapiens)
MA0113.2 (NR3C1; Mus musculus)
MA0113.3 (NR3C1; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0119.06.089.09.023.020.08.017.022.09.035.07.023.08.033.07.0
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0326.021.063.013.033.037.03.032.023.018.014.015.05.017.05.010.0
0429.023.030.05.033.029.05.026.052.011.015.07.015.012.036.07.0
0532.01.092.04.065.00.04.06.029.01.055.01.016.01.028.00.0
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100.00.00.00.0268.04.01.024.038.00.00.00.00.00.00.00.0
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1236.02.012.01.066.07.09.05.0111.020.032.08.05.02.016.03.0
1372.040.0102.04.012.07.05.07.026.016.025.02.02.06.08.01.0
1419.017.02.074.016.05.03.045.057.010.04.069.04.01.01.08.0
150.00.096.00.01.00.031.01.00.01.09.00.00.02.0194.00.0
160.00.00.01.00.00.00.03.057.05.08.0260.00.00.01.00.0
174.05.042.06.01.02.00.02.01.03.03.02.057.089.041.077.0
182.053.02.06.07.080.01.011.035.047.02.02.01.080.01.05.0
192.06.034.03.055.064.012.0129.01.01.03.01.01.014.02.07.0
2014.010.022.013.036.018.06.025.037.04.07.03.020.033.062.025.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.095-1.2081.434-0.8220.092-0.045-0.935-0.2040.049-0.8220.507-1.0620.092-0.9350.449-1.062
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10-4.071-4.071-4.071-4.0712.534-1.586-2.7490.1340.588-4.071-4.071-4.071-4.071-4.071-4.071-4.071
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