Check the newest release v13
Model info
Transcription factorHNF4G
(GeneCards)
ModelHNF4G_HUMAN.H11DI.0.B
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length15
Quality
B
Motif rank
0
ConsensusvRGdnCAAAGKYCRn
Best auROC (human)0.987
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)6
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words507
TF familyRXR-related receptors (NR2) {2.1.3}
TF subfamilyHNF-4 (NR2A) {2.1.3.2}
HGNCHGNC:5026
EntrezGeneGeneID:3174
(SSTAR profile)
UniProt IDHNF4G_HUMAN
UniProt ACQ14541
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 8.89976
0.0005 11.00771
0.0001 15.371110000000002
GTEx tissue expression atlas HNF4G expression
ReMap ChIP-seq dataset list HNF4G datasets
Motifs in JASPAR
MA0484.1 (HNF4G; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0163.04.063.08.078.02.014.029.074.04.087.017.09.02.041.05.0
0213.05.0192.014.01.01.08.02.019.05.0162.019.02.00.055.02.0
036.05.010.014.01.00.00.010.078.024.0141.0174.03.02.015.017.0
0415.013.035.025.05.04.03.019.036.034.060.036.021.0104.039.051.0
050.074.00.03.02.0139.00.014.00.0122.03.012.02.0121.03.05.0
063.00.01.00.0436.05.09.06.06.00.00.00.033.00.01.00.0
07403.04.070.01.04.00.01.00.010.00.01.00.05.00.01.00.0
08392.00.024.06.04.00.00.00.068.00.05.00.01.00.00.00.0
092.03.0451.09.00.00.00.00.00.00.029.00.01.00.05.00.0
100.00.03.00.00.00.00.03.08.03.0185.0289.00.00.01.08.0
111.01.01.05.00.00.00.03.03.033.044.0109.015.0216.012.057.0
120.017.02.00.01.0210.01.038.01.050.01.05.05.0140.05.024.0
134.01.02.00.0313.027.035.042.06.00.00.03.029.05.025.08.0
1474.092.0128.058.011.08.01.013.015.015.015.017.011.010.016.016.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.695-1.9750.695-1.3280.907-2.584-0.788-0.0740.855-1.9751.016-0.599-1.215-2.5840.269-1.77
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03-1.6-1.77-1.114-0.788-3.126-4.4-4.4-1.1140.907-0.261.4971.707-2.234-2.584-0.721-0.599
04-0.721-0.860.112-0.22-1.77-1.975-2.234-0.490.140.0830.6460.14-0.3921.1940.2190.485
05-4.40.855-4.4-2.234-2.5841.483-4.4-0.788-4.41.353-2.234-0.938-2.5841.345-2.234-1.77
06-2.234-4.4-3.126-4.42.624-1.77-1.215-1.6-1.6-4.4-4.4-4.40.054-4.4-3.126-4.4
072.546-1.9750.8-3.126-1.975-4.4-3.126-4.4-1.114-4.4-3.126-4.4-1.77-4.4-3.126-4.4
082.518-4.4-0.26-1.6-1.975-4.4-4.4-4.40.771-4.4-1.77-4.4-3.126-4.4-4.4-4.4
09-2.584-2.2342.658-1.215-4.4-4.4-4.4-4.4-4.4-4.4-0.074-4.4-3.126-4.4-1.77-4.4
10-4.4-4.4-2.234-4.4-4.4-4.4-4.4-2.234-1.328-2.2341.7682.213-4.4-4.4-3.126-1.328
11-3.126-3.126-3.126-1.77-4.4-4.4-4.4-2.234-2.2340.0540.3391.241-0.7211.923-0.9380.595
12-4.4-0.599-2.584-4.4-3.1261.895-3.1260.193-3.1260.465-3.126-1.77-1.771.49-1.77-0.26
13-1.975-3.126-2.584-4.42.293-0.1440.1120.293-1.6-4.4-4.4-2.234-0.074-1.77-0.22-1.328
140.8551.0721.4010.613-1.022-1.328-3.126-0.86-0.721-0.721-0.721-0.599-1.022-1.114-0.658-0.658