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Model info
Transcription factorIRF3
(GeneCards)
ModelIRF3_HUMAN.H11DI.0.B
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
B
Motif rank
0
ConsensusnvdRRMdRGAAAvnGAAAvndvv
Best auROC (human)0.797
Best auROC (mouse)0.962
Peak sets in benchmark (human)6
Peak sets in benchmark (mouse)21
Aligned words510
TF familyInterferon-regulatory factors {3.5.3}
TF subfamilyIRF-3 {3.5.3.0.3}
HGNCHGNC:6118
EntrezGeneGeneID:3661
(SSTAR profile)
UniProt IDIRF3_HUMAN
UniProt ACQ14653
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 9.612960000000001
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0.0001 16.42471
GTEx tissue expression atlas IRF3 expression
ReMap ChIP-seq dataset list IRF3 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0143.031.046.07.035.014.05.014.030.016.044.07.014.017.022.08.0
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2034.010.052.011.036.015.012.014.012.02.038.02.021.018.056.020.0
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2293.014.056.017.015.011.05.015.033.020.028.011.05.011.012.07.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.6590.3350.726-1.1130.455-0.445-1.43-0.4450.303-0.3150.682-1.113-0.445-0.256-0.003-0.986
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112.659-2.249-1.259-1.43-2.798-4.114-4.114-4.114-0.315-2.798-4.114-4.114-2.249-4.114-4.114-4.114
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13-0.518-2.249-0.518-0.7721.0540.704-0.3781.023-0.2-0.680.7480.367-1.636-1.636-0.986-1.43
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