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Model info
Transcription factorIrf8
ModelIRF8_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length22
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusddWWvdGGAASTGAAASYvvvd
Best auROC (human)
Best auROC (mouse)0.997
Peak sets in benchmark (human)
Peak sets in benchmark (mouse)59
Aligned words513
TF familyInterferon-regulatory factors {3.5.3}
TF subfamilyIRF-8 (ICSBP1) {3.5.3.0.8}
MGIMGI:96395
EntrezGeneGeneID:15900
(SSTAR profile)
UniProt IDIRF8_MOUSE
UniProt ACP23611
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 4.35336
0.0005 7.1734100000000005
0.0001 13.22906
GTEx tissue expression atlas Irf8 expression
Motifs in JASPAR
MA0652.1 (IRF8; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0177.010.038.014.037.06.02.010.079.09.018.018.022.07.011.022.0
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03149.014.037.041.012.00.02.04.033.03.09.09.021.02.09.035.0
0457.026.0121.011.015.01.01.02.027.08.018.04.027.06.050.06.0
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1820.02.032.02.050.011.012.010.08.01.09.00.056.037.0100.030.0
1943.020.049.022.021.09.010.011.072.022.042.017.08.09.022.03.0
2078.018.039.09.023.015.02.020.045.024.042.012.011.05.020.017.0
2194.018.027.018.020.014.03.025.042.018.027.016.016.08.014.020.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
011.166-0.8440.464-0.5180.438-1.331-2.32-0.8441.191-0.945-0.272-0.272-0.075-1.186-0.752-0.075
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080.849-4.174-2.32-2.867-4.174-4.174-4.174-4.1742.59-4.174-4.174-4.174-4.174-4.174-4.174-4.174
092.737-4.174-4.174-1.502-4.174-4.174-4.174-4.174-2.32-4.174-4.174-4.174-2.867-4.174-4.174-4.174
100.8131.4062.185-0.945-4.174-4.174-4.174-4.174-4.174-4.174-4.174-4.174-4.174-4.174-1.502-4.174
11-2.867-1.502-4.1740.696-0.121-1.186-4.1741.071-0.032-1.502-4.1742.071-4.174-2.867-4.174-1.058
12-4.174-4.1740.632-4.174-4.174-4.174-0.272-4.174-4.174-4.174-4.174-4.174-2.867-4.1742.571-2.867
13-2.867-4.174-4.174-4.174-4.174-4.174-4.174-4.1742.731-2.867-1.186-4.174-2.867-4.174-4.174-4.174
142.696-4.174-0.518-2.867-2.867-4.174-4.174-4.174-1.186-4.174-4.174-4.174-4.174-4.174-4.174-4.174
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17-2.867-4.174-2.867-1.058-0.1210.383-4.1741.310.3540.675-0.3881.656-4.174-2.867-2.867-4.174
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