Check the newest release v12
Model info
Transcription factorJUNB
(GeneCards)
ModelJUNB_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length12
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusndvTGAGTCAbh
Best auROC (human)0.975
Best auROC (mouse)0.922
Peak sets in benchmark (human)8
Peak sets in benchmark (mouse)25
Aligned words208
TF familyJun-related factors {1.1.1}
TF subfamilyJun factors {1.1.1.1}
HGNCHGNC:6205
EntrezGeneGeneID:3726
(SSTAR profile)
UniProt IDJUNB_HUMAN
UniProt ACP17275
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 7.077489999999999
0.0005 9.038965
0.0001 14.238125
GTEx tissue expression atlas JUNB expression
ReMap ChIP-seq dataset list JUNB datasets
Motifs in JASPAR
MA0490.1 (JUNB; Homo sapiens)
MA1132.1 (JUN::JUNB; Homo sapiens)
MA1134.1 (FOS::JUNB; Homo sapiens)
MA1135.1 (FOSB::JUNB; Homo sapiens)
MA1137.1 (FOSL1::JUNB; Homo sapiens)
MA1138.1 (FOSL2::JUNB; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
014.09.014.07.025.06.013.017.021.05.029.012.04.02.018.07.0
0218.011.021.04.014.03.02.03.024.019.030.01.03.015.025.00.0
032.01.00.056.00.00.00.048.00.00.00.078.01.00.01.06.0
040.01.01.01.00.00.01.00.00.01.00.00.00.00.0176.012.0
050.00.00.00.02.00.00.00.0174.02.00.02.013.00.00.00.0
069.00.0180.00.02.00.00.00.00.00.00.00.00.00.02.00.0
070.00.00.011.00.00.00.00.00.03.01.0178.00.00.00.00.0
080.00.00.00.00.03.00.00.00.00.01.00.08.0180.01.00.0
098.00.00.00.0182.00.01.00.01.00.00.01.00.00.00.00.0
104.087.043.057.00.00.00.00.00.00.01.00.00.01.00.00.0
111.02.01.00.023.032.09.024.010.021.07.06.08.023.019.07.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-1.052-0.2840.145-0.5250.715-0.6720.0730.3350.543-0.8440.862-0.005-1.052-1.6720.391-0.525
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03-1.672-2.233-3.6291.514-3.629-3.629-3.6291.361-3.629-3.629-3.6291.844-2.233-3.629-2.233-0.672
04-3.629-2.233-2.233-2.233-3.629-3.629-2.233-3.629-3.629-2.233-3.629-3.629-3.629-3.6292.655-0.005
05-3.629-3.629-3.629-3.629-1.672-3.629-3.629-3.6292.644-1.672-3.629-1.6720.073-3.629-3.629-3.629
06-0.284-3.6292.678-3.629-1.672-3.629-3.629-3.629-3.629-3.629-3.629-3.629-3.629-3.629-1.672-3.629
07-3.629-3.629-3.629-0.09-3.629-3.629-3.629-3.629-3.629-1.314-2.2332.667-3.629-3.629-3.629-3.629
08-3.629-3.629-3.629-3.629-3.629-1.314-3.629-3.629-3.629-3.629-2.233-3.629-0.3972.678-2.233-3.629
09-0.397-3.629-3.629-3.6292.689-3.629-2.233-3.629-2.233-3.629-3.629-2.233-3.629-3.629-3.629-3.629
10-1.0521.9531.2521.532-3.629-3.629-3.629-3.629-3.629-3.629-2.233-3.629-3.629-2.233-3.629-3.629
11-2.233-1.672-2.233-3.6290.6330.959-0.2840.675-0.1820.543-0.525-0.672-0.3970.6330.445-0.525