Check the newest release v12
Model info
Transcription factorJUND
(GeneCards)
ModelJUND_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length13
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnvnvTGAGTCAbn
Best auROC (human)0.997
Best auROC (mouse)0.987
Peak sets in benchmark (human)64
Peak sets in benchmark (mouse)21
Aligned words505
TF familyJun-related factors {1.1.1}
TF subfamilyJun factors {1.1.1.1}
HGNCHGNC:6206
EntrezGeneGeneID:3727
(SSTAR profile)
UniProt IDJUND_HUMAN
UniProt ACP17535
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 7.84131
0.0005 10.133860000000002
0.0001 15.026164999999999
GTEx tissue expression atlas JUND expression
ReMap ChIP-seq dataset list JUND datasets
Motifs in JASPAR
MA0491.1 (JUND; Homo sapiens)
MA1141.1 (FOS::JUND; Homo sapiens)
MA1142.1 (FOSL1::JUND; Homo sapiens)
MA1144.1 (FOSL2::JUND; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0138.018.072.019.018.032.05.030.040.037.059.021.012.021.064.013.0
0231.017.042.018.034.024.010.040.048.049.072.031.011.016.036.020.0
0354.014.052.04.069.026.09.02.069.044.043.04.032.031.043.03.0
044.02.00.0218.00.01.00.0114.00.00.01.0146.02.00.00.011.0
050.00.06.00.00.00.03.00.00.00.01.00.00.01.0462.026.0
060.00.00.00.01.00.00.00.0462.02.01.07.025.00.00.01.0
070.00.0413.075.00.00.02.00.00.00.01.00.00.00.06.02.0
080.00.00.00.00.00.00.00.06.08.03.0405.01.01.00.075.0
091.05.01.00.01.07.01.00.00.03.00.00.016.0450.014.00.0
1018.00.00.00.0463.01.01.00.012.00.02.02.00.00.00.00.0
1110.0149.096.0238.00.01.00.00.00.02.00.01.00.00.00.02.0
123.05.01.01.050.038.010.054.026.032.018.020.037.070.062.072.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.195-0.5410.83-0.488-0.5410.025-1.768-0.0380.2460.1690.632-0.39-0.936-0.390.713-0.858
02-0.006-0.5970.294-0.5410.085-0.258-1.1120.2460.4270.4470.83-0.006-1.02-0.6560.142-0.437
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05-4.398-4.398-1.598-4.398-4.398-4.398-2.232-4.398-4.398-4.398-3.124-4.398-4.398-3.1242.684-0.179
06-4.398-4.398-4.398-4.398-3.124-4.398-4.398-4.3982.684-2.582-3.124-1.452-0.218-4.398-4.398-3.124
07-4.398-4.3982.5720.87-4.398-4.398-2.582-4.398-4.398-4.398-3.124-4.398-4.398-4.398-1.598-2.582
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10-0.541-4.398-4.398-4.3982.686-3.124-3.124-4.398-0.936-4.398-2.582-2.582-4.398-4.398-4.398-4.398
11-1.1121.5541.1162.022-4.398-3.124-4.398-4.398-4.398-2.582-4.398-3.124-4.398-4.398-4.398-2.582
12-2.232-1.768-3.124-3.1240.4670.195-1.1120.544-0.1790.025-0.541-0.4370.1690.8020.6810.83