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Model info
Transcription factorKLF9
(GeneCards)
ModelKLF9_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length17
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusnSvvGKGGGCGTGKCvb
Best auROC (human)0.957
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)3
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words252
TF familyThree-zinc finger Krüppel-related factors {2.3.1}
TF subfamilyKrüppel-like factors {2.3.1.2}
HGNCHGNC:1123
EntrezGeneGeneID:687
(SSTAR profile)
UniProt IDKLF9_HUMAN
UniProt ACQ13886
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -0.76474
0.0005 1.8021599999999998
0.0001 7.414660000000001
GTEx tissue expression atlas KLF9 expression
ReMap ChIP-seq dataset list KLF9 datasets
Motifs in JASPAR
MA1107.1 (KLF9; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
011.012.026.05.05.014.029.03.05.010.062.011.04.010.035.04.0
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0329.07.019.04.021.010.011.07.057.017.019.012.07.01.011.04.0
0414.00.0100.00.04.02.027.02.09.01.047.03.01.00.026.00.0
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070.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0235.01.00.00.00.00.0
080.00.00.00.00.00.00.00.01.01.0233.00.00.00.01.00.0
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100.00.01.00.00.00.0187.00.00.00.00.00.00.00.048.00.0
110.00.00.00.00.00.00.00.00.01.058.0177.00.00.00.00.0
120.00.00.00.00.00.01.00.00.00.056.02.00.00.0176.01.0
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151.00.00.01.031.0109.038.024.02.03.02.01.00.012.06.06.0
162.010.021.01.021.027.046.030.08.018.014.06.03.012.014.03.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-2.42-0.2010.557-1.039-1.039-0.0510.665-1.508-1.039-0.3781.418-0.286-1.246-0.3780.851-1.246
02-0.867-1.508-0.867-3.789-0.721-0.1230.299-0.8671.0550.5571.553-0.201-1.508-0.721-0.593-1.039
030.665-0.7210.248-1.2460.347-0.378-0.286-0.7211.3350.1390.248-0.201-0.721-2.42-0.286-1.246
04-0.051-3.7891.894-3.789-1.246-1.8630.594-1.863-0.48-2.421.143-1.508-2.42-3.7890.557-3.789
05-2.42-3.7890.392-1.039-3.789-3.789-2.42-1.863-1.508-3.7892.1481.51-3.789-3.789-1.246-2.42
06-3.789-3.789-1.246-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.7892.338-3.789-3.789-3.7891.621-3.789
07-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.7892.747-2.42-3.789-3.789-3.789-3.789
08-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-2.42-2.422.738-3.789-3.789-3.789-2.42-3.789
09-3.789-3.789-3.789-2.42-3.789-3.789-3.789-2.42-2.422.519-3.7891.122-3.789-3.789-3.789-3.789
10-3.789-3.789-2.42-3.789-3.789-3.7892.519-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.7891.164-3.789
11-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-2.421.3522.464-3.789-3.789-3.789-3.789
12-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-2.42-3.789-3.789-3.7891.317-1.863-3.789-3.7892.458-2.42
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