We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorKLF9
(GeneCards)
ModelKLF9_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length17
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusnSvvGKGGGCGTGKCvb
Best auROC (human)0.957
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)3
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words252
TF familyThree-zinc finger Krüppel-related factors {2.3.1}
TF subfamilyKrüppel-like factors {2.3.1.2}
HGNCHGNC:1123
EntrezGeneGeneID:687
(SSTAR profile)
UniProt IDKLF9_HUMAN
UniProt ACQ13886
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -0.76474
0.0005 1.8021599999999998
0.0001 7.414660000000001
GTEx tissue expression atlas KLF9 expression
ReMap ChIP-seq dataset list KLF9 datasets
Motifs in JASPAR
MA1107.1 (KLF9; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
011.012.026.05.05.014.029.03.05.010.062.011.04.010.035.04.0
026.03.06.00.07.013.020.06.043.026.071.012.03.07.08.05.0
0329.07.019.04.021.010.011.07.057.017.019.012.07.01.011.04.0
0414.00.0100.00.04.02.027.02.09.01.047.03.01.00.026.00.0
051.00.022.05.00.00.01.02.03.00.0129.068.00.00.04.01.0
060.00.04.00.00.00.00.00.00.00.0156.00.00.00.076.00.0
070.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0235.01.00.00.00.00.0
080.00.00.00.00.00.00.00.01.01.0233.00.00.00.01.00.0
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100.00.01.00.00.00.0187.00.00.00.00.00.00.00.048.00.0
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151.00.00.01.031.0109.038.024.02.03.02.01.00.012.06.06.0
162.010.021.01.021.027.046.030.08.018.014.06.03.012.014.03.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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02-0.867-1.508-0.867-3.789-0.721-0.1230.299-0.8671.0550.5571.553-0.201-1.508-0.721-0.593-1.039
030.665-0.7210.248-1.2460.347-0.378-0.286-0.7211.3350.1390.248-0.201-0.721-2.42-0.286-1.246
04-0.051-3.7891.894-3.789-1.246-1.8630.594-1.863-0.48-2.421.143-1.508-2.42-3.7890.557-3.789
05-2.42-3.7890.392-1.039-3.789-3.789-2.42-1.863-1.508-3.7892.1481.51-3.789-3.789-1.246-2.42
06-3.789-3.789-1.246-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.7892.338-3.789-3.789-3.7891.621-3.789
07-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.7892.747-2.42-3.789-3.789-3.789-3.789
08-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-2.42-2.422.738-3.789-3.789-3.789-2.42-3.789
09-3.789-3.789-3.789-2.42-3.789-3.789-3.789-2.42-2.422.519-3.7891.122-3.789-3.789-3.789-3.789
10-3.789-3.789-2.42-3.789-3.789-3.7892.519-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.7891.164-3.789
11-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-2.421.3522.464-3.789-3.789-3.789-3.789
12-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-3.789-2.42-3.789-3.789-3.7891.317-1.863-3.789-3.7892.458-2.42
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15-2.42-3.789-3.789-2.420.7311.980.9320.478-1.863-1.508-1.863-2.42-3.789-0.201-0.867-0.867
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