Check the newest release v12
Model info
Transcription factorMYC
(GeneCards)
ModelMYC_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length15
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnvCCACGTGbnbdvn
Best auROC (human)0.951
Best auROC (mouse)0.948
Peak sets in benchmark (human)265
Peak sets in benchmark (mouse)126
Aligned words116
TF familybHLH-ZIP factors {1.2.6}
TF subfamilyMyc / Max factors {1.2.6.5}
HGNCHGNC:7553
EntrezGeneGeneID:4609
(SSTAR profile)
UniProt IDMYC_HUMAN
UniProt ACP01106
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 4.586359999999999
0.0005 6.53156
0.0001 11.079410000000001
GTEx tissue expression atlas MYC expression
ReMap ChIP-seq dataset list MYC datasets
Motifs in JASPAR
MA0059.1 (MAX::MYC; Homo sapiens)
MA0147.1 (Myc; Mus musculus)
MA0147.2 (Myc; Mus musculus)
MA0147.3 (MYC; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0111.01.015.00.010.07.08.08.06.08.011.02.06.07.015.01.0
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030.011.00.00.03.091.02.00.00.08.00.01.00.00.00.00.0
043.00.00.00.099.00.05.06.00.00.01.01.01.00.00.00.0
050.082.00.021.00.00.00.00.00.06.00.00.00.07.00.00.0
060.00.00.00.00.01.094.00.00.00.00.00.00.00.021.00.0
070.00.00.00.00.00.00.01.01.02.00.0112.00.00.00.00.0
080.00.00.01.00.00.02.00.00.00.00.00.00.00.0113.00.0
090.00.00.00.00.00.00.00.05.055.030.025.00.00.01.00.0
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118.08.07.04.03.07.02.05.02.011.07.08.04.028.07.05.0
125.06.04.02.017.06.018.013.08.03.09.03.05.02.012.03.0
137.07.017.04.01.010.04.02.010.022.09.02.01.011.08.01.0
140.08.07.04.011.016.010.013.07.013.09.09.00.05.01.03.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.403-1.7610.706-3.2350.311-0.0340.0950.095-0.1810.0950.403-1.19-0.181-0.0340.706-1.761
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03-3.2350.403-3.235-3.235-0.8282.493-1.19-3.235-3.2350.095-3.235-1.761-3.235-3.235-3.235-3.235
04-0.828-3.235-3.235-3.2352.577-3.235-0.354-0.181-3.235-3.235-1.761-1.761-1.761-3.235-3.235-3.235
05-3.2352.389-3.2351.037-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-0.181-3.235-3.235-3.235-0.034-3.235-3.235
06-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-1.7612.525-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-3.2351.037-3.235
07-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-1.761-1.761-1.19-3.2352.7-3.235-3.235-3.235-3.235
08-3.235-3.235-3.235-1.761-3.235-3.235-1.19-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-3.2352.709-3.235
09-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-0.3541.9921.391.21-3.235-3.235-1.761-3.235
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