We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorMYC
(GeneCards)
ModelMYC_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length15
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnvCCACGTGbnbdvn
Best auROC (human)0.951
Best auROC (mouse)0.948
Peak sets in benchmark (human)265
Peak sets in benchmark (mouse)126
Aligned words116
TF familybHLH-ZIP factors {1.2.6}
TF subfamilyMyc / Max factors {1.2.6.5}
HGNCHGNC:7553
EntrezGeneGeneID:4609
(SSTAR profile)
UniProt IDMYC_HUMAN
UniProt ACP01106
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 4.586359999999999
0.0005 6.53156
0.0001 11.079410000000001
GTEx tissue expression atlas MYC expression
ReMap ChIP-seq dataset list MYC datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0111.01.015.00.010.07.08.08.06.08.011.02.06.07.015.01.0
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030.011.00.00.03.091.02.00.00.08.00.01.00.00.00.00.0
043.00.00.00.099.00.05.06.00.00.01.01.01.00.00.00.0
050.082.00.021.00.00.00.00.00.06.00.00.00.07.00.00.0
060.00.00.00.00.01.094.00.00.00.00.00.00.00.021.00.0
070.00.00.00.00.00.00.01.01.02.00.0112.00.00.00.00.0
080.00.00.01.00.00.02.00.00.00.00.00.00.00.0113.00.0
090.00.00.00.00.00.00.00.05.055.030.025.00.00.01.00.0
100.03.01.01.011.02.012.030.014.06.08.03.02.06.07.010.0
118.08.07.04.03.07.02.05.02.011.07.08.04.028.07.05.0
125.06.04.02.017.06.018.013.08.03.09.03.05.02.012.03.0
137.07.017.04.01.010.04.02.010.022.09.02.01.011.08.01.0
140.08.07.04.011.016.010.013.07.013.09.09.00.05.01.03.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.403-1.7610.706-3.2350.311-0.0340.0950.095-0.1810.0950.403-1.19-0.181-0.0340.706-1.761
02-0.8281.322-1.19-3.235-0.8280.886-1.19-3.235-0.5631.747-1.19-3.235-1.761-0.034-0.828-3.235
03-3.2350.403-3.235-3.235-0.8282.493-1.19-3.235-3.2350.095-3.235-1.761-3.235-3.235-3.235-3.235
04-0.828-3.235-3.235-3.2352.577-3.235-0.354-0.181-3.235-3.235-1.761-1.761-1.761-3.235-3.235-3.235
05-3.2352.389-3.2351.037-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-0.181-3.235-3.235-3.235-0.034-3.235-3.235
06-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-1.7612.525-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-3.2351.037-3.235
07-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-1.761-1.761-1.19-3.2352.7-3.235-3.235-3.235-3.235
08-3.235-3.235-3.235-1.761-3.235-3.235-1.19-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-3.2352.709-3.235
09-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-3.235-0.3541.9921.391.21-3.235-3.235-1.761-3.235
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110.0950.095-0.034-0.563-0.828-0.034-1.19-0.354-1.190.403-0.0340.095-0.5631.322-0.034-0.354
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