We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorZNF146
(GeneCards)
ModelOZF_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length27
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusYCYTTTTYATGGCTGMATARTATTCCA
Best auROC (human)0.992
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words453
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyZNF146-like factors {2.3.3.55}
HGNCHGNC:12931
EntrezGeneGeneID:7705
(SSTAR profile)
UniProt IDOZF_HUMAN
UniProt ACQ15072
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -21.69804
0.0005 -17.89474
0.0001 -9.558589999999999
GTEx tissue expression atlas ZNF146 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF146 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.01.00.01.018.0103.01.03.03.08.00.00.08.0297.03.04.0
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240.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.01.0445.00.04.0
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PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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03-4.313-4.313-4.313-1.351-4.313-4.313-4.3131.872-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.3132.204
04-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-1.351-1.012.721
05-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-1.351-4.313-4.313-4.313-1.01-4.313-3.027-3.0272.717
06-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-3.027-4.313-4.313-4.313-3.027-2.132-4.313-2.4822.744
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12-4.313-1.224-4.313-3.027-4.313-3.027-4.313-4.313-4.3132.684-1.351-0.554-4.313-4.313-4.313-4.313
13-4.313-4.313-4.313-4.313-1.497-0.617-4.3132.655-4.313-4.313-4.313-1.351-3.027-3.027-4.313-0.617
14-4.313-4.313-1.351-4.313-2.482-4.313-0.756-3.027-4.313-4.313-4.313-4.313-0.918-1.8732.669-3.027
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161.097-1.2240.815-4.3131.888-4.313-0.386-4.313-4.313-4.313-3.027-4.3130.682-3.027-0.004-4.313
17-4.313-4.313-4.3132.447-4.313-4.313-4.313-1.111-4.313-4.313-4.3131.372-4.313-4.313-4.313-4.313
18-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.3132.737-2.132-1.873-2.132
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20-4.313-4.313-4.3131.622-4.313-3.027-4.313-0.077-4.313-2.482-4.3132.261-4.313-4.313-4.313-1.873
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22-4.3130.42-2.1322.625-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-4.313-1.111-4.313-4.313-4.313-2.482
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