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Model info
Transcription factorTP53
(GeneCards)
ModelP53_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnndRRCAKGbMSMRACAWGbMbn
Best auROC (human)0.997
Best auROC (mouse)0.988
Peak sets in benchmark (human)141
Peak sets in benchmark (mouse)39
Aligned words598
TF familyp53-related factors {6.3.1}
TF subfamilyp53 {6.3.1.0.1}
HGNCHGNC:11998
EntrezGeneGeneID:7157
(SSTAR profile)
UniProt IDP53_HUMAN
UniProt ACP04637
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 3.45641
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0.0001 10.95046
GTEx tissue expression atlas TP53 expression
ReMap ChIP-seq dataset list TP53 datasets
Motifs in JASPAR
MA0106.1 (TP53; Homo sapiens)
MA0106.2 (TP53; Homo sapiens)
MA0106.3 (TP53; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0117.068.065.015.018.041.02.032.022.036.047.040.014.021.039.012.0
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PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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