We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorPOU2F1
(GeneCards)
ModelPO2F1_HUMAN.H11DI.0.B
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length19
Quality
B
Motif rank
0
ConsensusnbnYATGYAdATdhvnndn
Best auROC (human)0.822
Best auROC (mouse)0.687
Peak sets in benchmark (human)15
Peak sets in benchmark (mouse)14
Aligned words103
TF familyPOU domain factors {3.1.10}
TF subfamilyPOU2 (Oct-1/2-like factors) {3.1.10.2}
HGNCHGNC:9212
EntrezGeneGeneID:5451
(SSTAR profile)
UniProt IDPO2F1_HUMAN
UniProt ACP14859
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 9.44071
0.0005 11.23956
0.0001 15.02341
GTEx tissue expression atlas POU2F1 expression
ReMap ChIP-seq dataset list POU2F1 datasets
Motifs in JASPAR
MA0785.1 (POU2F1; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
018.02.010.02.00.017.05.01.03.06.018.04.01.09.08.08.0
026.01.01.04.017.03.07.07.013.010.014.04.05.05.01.04.0
031.023.02.015.03.02.02.012.01.08.00.014.00.05.03.011.0
043.00.02.00.027.01.01.09.05.01.00.01.048.00.02.02.0
051.01.02.079.00.00.00.02.00.00.02.03.01.01.00.010.0
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123.01.01.03.02.00.00.02.01.00.01.00.029.07.021.031.0
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154.01.012.014.011.02.02.02.06.09.021.05.07.03.02.01.0
163.012.04.09.05.05.04.01.04.016.03.014.06.01.05.010.0
179.00.03.06.026.01.04.03.06.01.08.01.02.011.012.09.0
1815.04.017.07.02.02.02.07.06.09.08.04.02.06.07.04.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.218-1.0690.434-1.069-3.1380.953-0.231-1.643-0.706-0.0581.01-0.441-1.6430.3320.2180.218
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03-1.6431.251-1.0690.83-0.706-1.069-1.0690.612-1.6430.218-3.1380.763-3.138-0.231-0.7060.527
04-0.706-3.138-1.069-3.1381.41-1.643-1.6430.332-0.231-1.643-3.138-1.6431.98-3.138-1.069-1.069
05-1.643-1.643-1.0692.476-3.138-3.138-3.138-1.069-3.138-3.138-1.069-0.706-1.643-1.643-3.1380.434
06-3.138-1.069-3.138-3.138-1.643-3.138-1.643-3.138-3.138-3.138-0.441-3.1380.332-1.6432.526-1.643
07-1.069-0.058-1.643-1.643-1.069-3.138-3.138-1.6430.092.327-3.1380.69-3.138-1.643-3.138-3.138
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092.06-3.1381.2071.161-3.138-3.138-3.138-3.138-3.138-3.138-3.138-3.138-0.441-3.138-1.643-1.069
102.116-3.138-1.643-3.138-3.138-3.138-3.138-3.1381.207-3.138-1.643-3.1381.161-3.138-3.138-1.069
11-0.058-0.706-1.6432.584-3.138-3.138-3.138-3.138-1.069-3.138-3.138-3.138-3.138-1.643-1.643-3.138
12-0.706-1.643-1.643-0.706-1.069-3.138-3.138-1.069-1.643-3.138-1.643-3.1381.480.091.1611.547
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140.218-0.7061.547-3.1380.953-0.231-1.069-1.069-1.643-0.706-3.138-3.138-0.231-0.0580.2180.527
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