We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorPOU3F2
(GeneCards)
ModelPO3F2_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length20
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnbdSMTGMATWWKbMWddvn
Best auROC (human)0.813
Best auROC (mouse)0.945
Peak sets in benchmark (human)12
Peak sets in benchmark (mouse)22
Aligned words330
TF familyPOU domain factors {3.1.10}
TF subfamilyPOU3 (Oct-6-like factors) {3.1.10.3}
HGNCHGNC:9215
EntrezGeneGeneID:5454
(SSTAR profile)
UniProt IDPO3F2_HUMAN
UniProt ACP20265
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 8.70831
0.0005 10.66611
0.0001 14.77326
GTEx tissue expression atlas POU3F2 expression
ReMap ChIP-seq dataset list POU3F2 datasets
Motifs in JASPAR
MA0787.1 (POU3F2; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0118.036.028.08.015.044.06.015.06.036.029.020.04.026.027.07.0
026.02.017.018.048.05.04.085.025.014.023.028.06.01.017.026.0
037.045.025.08.02.014.03.03.09.040.03.09.011.095.034.017.0
0421.02.06.00.0164.024.02.04.028.017.06.014.029.04.03.01.0
050.00.012.0230.03.01.00.043.01.00.00.016.05.01.00.013.0
060.01.08.00.01.00.01.00.05.00.06.01.04.01.0296.01.0
073.03.04.00.00.01.01.00.0191.0114.06.00.01.00.00.01.0
08187.03.05.00.0106.04.01.07.04.02.04.01.01.00.00.00.0
094.07.024.0263.00.01.01.07.01.01.05.03.01.03.01.03.0
104.00.00.02.07.02.00.03.019.08.02.02.0212.011.013.040.0
11102.011.02.0127.09.04.00.08.08.04.01.02.035.06.05.01.0
1216.02.015.0121.05.03.02.015.00.01.03.04.03.08.087.040.0
137.08.04.05.03.04.07.00.01.062.013.031.00.030.0102.048.0
141.09.00.01.093.08.01.02.025.073.017.011.030.048.04.02.0
1526.08.09.0106.0126.04.00.08.019.01.00.02.012.01.01.02.0
1611.025.028.0119.07.02.00.05.02.01.03.04.017.06.076.019.0
1711.04.016.06.026.00.04.04.061.08.017.021.036.09.073.029.0
1824.022.078.010.08.03.07.03.036.014.050.010.014.06.030.010.0
1925.013.034.010.014.07.010.014.044.032.052.037.02.023.02.06.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.1190.5650.316-0.905-0.2970.763-1.179-0.297-1.1790.5650.351-0.015-1.5560.2430.28-1.033
02-1.179-2.17-0.175-0.1190.85-1.35-1.5561.4180.204-0.3640.1220.316-1.179-2.72-0.1750.243
03-1.0330.7860.204-0.905-2.17-0.364-1.816-1.816-0.7920.669-1.816-0.792-0.5991.5290.508-0.175
040.033-2.17-1.179-4.0462.0730.164-2.17-1.5560.316-0.175-1.179-0.3640.351-1.556-1.816-2.72
05-4.046-4.046-0.5142.411-1.816-2.72-4.0460.741-2.72-4.046-4.046-0.234-1.35-2.72-4.046-0.436
06-4.046-2.72-0.905-4.046-2.72-4.046-2.72-4.046-1.35-4.046-1.179-2.72-1.556-2.722.663-2.72
07-1.816-1.816-1.556-4.046-4.046-2.72-2.72-4.0462.2251.71-1.179-4.046-2.72-4.046-4.046-2.72
082.204-1.816-1.35-4.0461.638-1.556-2.72-1.033-1.556-2.17-1.556-2.72-2.72-4.046-4.046-4.046
09-1.556-1.0330.1642.545-4.046-2.72-2.72-1.033-2.72-2.72-1.35-1.816-2.72-1.816-2.72-1.816
10-1.556-4.046-4.046-2.17-1.033-2.17-4.046-1.816-0.066-0.905-2.17-2.172.329-0.599-0.4360.669
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12-0.234-2.17-0.2971.77-1.35-1.816-2.17-0.297-4.046-2.72-1.816-1.556-1.816-0.9051.4410.669
13-1.033-0.905-1.556-1.35-1.816-1.556-1.033-4.046-2.721.104-0.4360.417-4.0460.3841.60.85
14-2.72-0.792-4.046-2.721.508-0.905-2.72-2.170.2041.267-0.175-0.5990.3840.85-1.556-2.17
150.243-0.905-0.7921.6381.81-1.556-4.046-0.905-0.066-2.72-4.046-2.17-0.514-2.72-2.72-2.17
16-0.5990.2040.3161.753-1.033-2.17-4.046-1.35-2.17-2.72-1.816-1.556-0.175-1.1791.307-0.066
17-0.599-1.556-0.234-1.1790.243-4.046-1.556-1.5561.088-0.905-0.1750.0330.565-0.7921.2670.351
180.1640.0781.332-0.691-0.905-1.816-1.033-1.8160.565-0.3640.89-0.691-0.364-1.1790.384-0.691
190.204-0.4360.508-0.691-0.364-1.033-0.691-0.3640.7630.4480.9290.592-2.170.122-2.17-1.179