We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorPou3f2
ModelPO3F2_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length19
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusbdnnbdYATGMATAWKYMW
Best auROC (human)0.787
Best auROC (mouse)0.956
Peak sets in benchmark (human)12
Peak sets in benchmark (mouse)22
Aligned words385
TF familyPOU domain factors {3.1.10}
TF subfamilyPOU3 (Oct-6-like factors) {3.1.10.3}
MGIMGI:101895
EntrezGeneGeneID:18992
(SSTAR profile)
UniProt IDPO3F2_MOUSE
UniProt ACP31360
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 7.823860000000001
0.0005 9.92266
0.0001 14.384360000000001
GTEx tissue expression atlas Pou3f2 expression
Motifs in JASPAR
MA0787.1 (POU3F2; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0130.07.013.012.044.015.06.033.026.09.019.019.054.05.056.033.0
0243.034.020.057.015.011.01.09.026.020.015.033.025.019.023.030.0
0340.017.028.024.039.022.04.019.013.023.010.013.044.020.035.030.0
049.057.013.057.011.030.02.039.07.038.010.022.08.038.016.024.0
0515.08.04.08.061.07.05.090.011.09.05.016.059.019.031.033.0
0612.090.03.041.07.028.00.08.03.026.01.015.011.0115.02.019.0
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091.00.00.00.03.00.02.00.01.02.02.00.085.06.0275.04.0
1043.045.01.01.02.05.00.01.0134.0134.02.09.02.02.00.00.0
11179.00.02.00.0178.04.00.04.01.01.00.01.08.01.00.02.0
125.07.01.0353.00.01.00.05.01.00.00.01.00.01.01.05.0
134.00.00.02.08.01.00.00.01.01.00.00.0320.02.02.040.0
1458.017.05.0253.02.00.00.02.00.01.00.01.025.02.01.014.0
1512.01.02.070.08.01.01.010.00.00.03.03.014.05.0130.0121.0
165.018.01.010.01.06.00.00.02.0108.09.017.09.0113.048.034.0
179.07.01.00.0234.03.01.07.010.041.07.00.029.019.06.07.0
1843.07.015.0217.062.03.01.04.07.06.00.02.06.02.01.05.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.228-1.188-0.593-0.670.607-0.453-1.3340.3220.087-0.948-0.222-0.2220.81-1.5050.8460.322
020.5840.352-0.1720.864-0.453-0.755-2.87-0.9480.087-0.172-0.4530.3220.048-0.222-0.0340.228
030.512-0.3310.160.0080.487-0.078-1.711-0.222-0.593-0.034-0.847-0.5930.607-0.1720.380.228
04-0.9480.864-0.5930.864-0.7550.228-2.3220.487-1.1880.462-0.847-0.078-1.0610.462-0.390.008
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070.292-2.87-4.176-4.1762.321-1.97-4.176-0.847-1.334-4.176-4.176-4.1761.082-1.97-4.176-0.948
08-2.87-1.97-1.972.668-4.176-4.176-4.176-1.188-4.176-4.176-4.176-4.176-4.176-2.322-2.322-0.453
09-2.87-4.176-4.176-4.176-1.97-4.176-2.322-4.176-2.87-2.322-2.322-4.1761.261-1.3342.432-1.711
100.5840.629-2.87-2.87-2.322-1.505-4.176-2.871.7151.715-2.322-0.948-2.322-2.322-4.176-4.176
112.004-4.176-2.322-4.1761.998-1.711-4.176-1.711-2.87-2.87-4.176-2.87-1.061-2.87-4.176-2.322
12-1.505-1.188-2.872.682-4.176-2.87-4.176-1.505-2.87-4.176-4.176-2.87-4.176-2.87-2.87-1.505
13-1.711-4.176-4.176-2.322-1.061-2.87-4.176-4.176-2.87-2.87-4.176-4.1762.584-2.322-2.3220.512
140.881-0.331-1.5052.349-2.322-4.176-4.176-2.322-4.176-2.87-4.176-2.870.048-2.322-2.87-0.52
15-0.67-2.87-2.3221.068-1.061-2.87-2.87-0.847-4.176-4.176-1.97-1.97-0.52-1.5051.6851.613
16-1.505-0.275-2.87-0.847-2.87-1.334-4.176-4.176-2.3221.5-0.948-0.331-0.9481.5450.6930.352
17-0.948-1.188-2.87-4.1762.271-1.97-2.87-1.188-0.8470.537-1.188-4.1760.194-0.222-1.334-1.188
180.584-1.188-0.4532.1960.947-1.97-2.87-1.711-1.188-1.334-4.176-2.322-1.334-2.322-2.87-1.505