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Model info
Transcription factorREST
(GeneCards)
ModelREST_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length24
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnbYCAGSACCdhGGACAGYdSYhn
Best auROC (human)0.999
Best auROC (mouse)0.996
Peak sets in benchmark (human)147
Peak sets in benchmark (mouse)33
Aligned words319
TF familyFactors with multiple dispersed zinc fingers {2.3.4}
TF subfamilyunclassified {2.3.4.0}
HGNCHGNC:9966
EntrezGeneGeneID:5978
(SSTAR profile)
UniProt IDREST_HUMAN
UniProt ACQ13127
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -2.10274
0.0005 0.45346000000000003
0.0001 6.04766
GTEx tissue expression atlas REST expression
ReMap ChIP-seq dataset list REST datasets
Motifs in JASPAR
MA0138.1 (REST; Homo sapiens)
MA0138.2 (REST; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
016.021.014.026.017.08.020.042.09.010.039.038.01.07.07.054.0
020.012.08.013.04.019.03.020.08.016.012.044.00.013.09.0138.0
030.010.02.00.04.042.07.07.02.021.05.04.05.0205.04.01.0
043.02.05.01.0264.08.04.02.07.07.01.03.03.02.04.03.0
052.01.0274.00.08.06.03.02.00.04.010.00.00.03.06.00.0
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160.00.01.00.0265.03.02.00.034.04.03.01.05.00.01.00.0
176.03.0294.01.00.00.05.02.02.01.02.02.00.00.01.00.0
180.03.05.00.00.01.01.02.025.0221.022.034.00.01.04.00.0
191.02.019.03.056.02.084.084.07.00.021.04.05.00.021.010.0
207.037.021.04.02.01.01.00.025.078.034.08.03.094.02.02.0
211.029.01.06.024.0168.01.017.06.038.05.09.00.013.00.01.0
225.014.010.02.091.0103.012.042.01.04.01.01.05.014.07.07.0
2313.032.040.017.052.038.023.022.04.015.06.05.02.012.030.08.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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04-1.798-2.152-1.331-2.7032.567-0.887-1.538-2.152-1.014-1.014-2.703-1.798-1.798-2.152-1.538-1.798
05-2.152-2.7032.604-4.031-0.887-1.16-1.798-2.152-4.031-1.538-0.673-4.031-4.031-1.798-1.16-4.031
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12-1.798-2.7030.662-4.031-1.538-2.1521.568-1.538-2.152-4.031-0.1-4.031-2.703-4.0311.976-2.152
13-4.031-4.031-0.774-2.703-4.031-2.703-2.703-2.703-1.331-4.0312.671-2.152-2.703-4.031-1.538-2.703
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22-1.331-0.346-0.673-2.1521.5041.628-0.4960.736-2.703-1.538-2.703-2.703-1.331-0.346-1.014-1.014
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