We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorREST
(GeneCards)
ModelREST_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length24
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnbYCAGSACCdhGGACAGYdSYhn
Best auROC (human)0.999
Best auROC (mouse)0.996
Peak sets in benchmark (human)147
Peak sets in benchmark (mouse)33
Aligned words319
TF familyFactors with multiple dispersed zinc fingers {2.3.4}
TF subfamilyunclassified {2.3.4.0}
HGNCHGNC:9966
EntrezGeneGeneID:5978
(SSTAR profile)
UniProt IDREST_HUMAN
UniProt ACQ13127
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -2.10274
0.0005 0.45346000000000003
0.0001 6.04766
GTEx tissue expression atlas REST expression
ReMap ChIP-seq dataset list REST datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
016.021.014.026.017.08.020.042.09.010.039.038.01.07.07.054.0
020.012.08.013.04.019.03.020.08.016.012.044.00.013.09.0138.0
030.010.02.00.04.042.07.07.02.021.05.04.05.0205.04.01.0
043.02.05.01.0264.08.04.02.07.07.01.03.03.02.04.03.0
052.01.0274.00.08.06.03.02.00.04.010.00.00.03.06.00.0
063.02.05.00.06.03.02.03.017.0211.045.020.00.00.02.00.0
0713.03.010.00.0207.01.03.05.042.05.05.02.019.00.02.02.0
080.0276.04.01.00.00.03.06.01.05.07.07.00.01.06.02.0
091.00.00.00.04.0263.02.013.06.06.06.02.00.06.08.02.0
104.01.06.00.0158.023.045.049.00.010.04.02.01.04.09.03.0
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123.01.039.00.04.02.097.04.02.00.018.00.01.00.0146.02.0
130.00.09.01.00.01.01.01.05.00.0293.02.01.00.04.01.0
142.00.03.01.01.00.00.00.0272.019.04.012.00.00.01.04.0
150.0236.034.05.01.017.01.00.00.05.03.00.00.012.04.01.0
160.00.01.00.0265.03.02.00.034.04.03.01.05.00.01.00.0
176.03.0294.01.00.00.05.02.02.01.02.02.00.00.01.00.0
180.03.05.00.00.01.01.02.025.0221.022.034.00.01.04.00.0
191.02.019.03.056.02.084.084.07.00.021.04.05.00.021.010.0
207.037.021.04.02.01.01.00.025.078.034.08.03.094.02.02.0
211.029.01.06.024.0168.01.017.06.038.05.09.00.013.00.01.0
225.014.010.02.091.0103.012.042.01.04.01.01.05.014.07.07.0
2313.032.040.017.052.038.023.022.04.015.06.05.02.012.030.08.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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03-4.031-0.673-2.152-4.031-1.5380.736-1.014-1.014-2.1520.051-1.331-1.538-1.3312.314-1.538-2.703
04-1.798-2.152-1.331-2.7032.567-0.887-1.538-2.152-1.014-1.014-2.703-1.798-1.798-2.152-1.538-1.798
05-2.152-2.7032.604-4.031-0.887-1.16-1.798-2.152-4.031-1.538-0.673-4.031-4.031-1.798-1.16-4.031
06-1.798-2.152-1.331-4.031-1.16-1.798-2.152-1.798-0.1562.3430.8040.003-4.031-4.031-2.152-4.031
07-0.418-1.798-0.673-4.0312.324-2.703-1.798-1.3310.736-1.331-1.331-2.152-0.047-4.031-2.152-2.152
08-4.0312.611-1.538-2.703-4.031-4.031-1.798-1.16-2.703-1.331-1.014-1.014-4.031-2.703-1.16-2.152
09-2.703-4.031-4.031-4.031-1.5382.563-2.152-0.418-1.16-1.16-1.16-2.152-4.031-1.16-0.887-2.152
10-1.538-2.703-1.16-4.0312.0540.1410.8040.889-4.031-0.673-1.538-2.152-2.703-1.538-0.774-1.798
110.3341.003-0.581.229-2.703-1.538-4.0310.497-0.7740.466-1.331-0.1-1.331-0.216-1.5380.369
12-1.798-2.7030.662-4.031-1.538-2.1521.568-1.538-2.152-4.031-0.1-4.031-2.703-4.0311.976-2.152
13-4.031-4.031-0.774-2.703-4.031-2.703-2.703-2.703-1.331-4.0312.671-2.152-2.703-4.031-1.538-2.703
14-2.152-4.031-1.798-2.703-2.703-4.031-4.031-4.0312.597-0.047-1.538-0.496-4.031-4.031-2.703-1.538
15-4.0312.4550.526-1.331-2.703-0.156-2.703-4.031-4.031-1.331-1.798-4.031-4.031-0.496-1.538-2.703
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17-1.16-1.7982.674-2.703-4.031-4.031-1.331-2.152-2.152-2.703-2.152-2.152-4.031-4.031-2.703-4.031
18-4.031-1.798-1.331-4.031-4.031-2.703-2.703-2.1520.2232.3890.0970.526-4.031-2.703-1.538-4.031
19-2.703-2.152-0.047-1.7981.021-2.1521.4251.425-1.014-4.0310.051-1.538-1.331-4.0310.051-0.673
20-1.0140.610.051-1.538-2.152-2.703-2.703-4.0310.2231.3510.526-0.887-1.7981.537-2.152-2.152
21-2.7030.369-2.703-1.160.1822.116-2.703-0.156-1.160.637-1.331-0.774-4.031-0.418-4.031-2.703
22-1.331-0.346-0.673-2.1521.5041.628-0.4960.736-2.703-1.538-2.703-2.703-1.331-0.346-1.014-1.014
23-0.4180.4660.687-0.1560.9480.6370.1410.097-1.538-0.279-1.16-1.331-2.152-0.4960.403-0.887