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Model info
Transcription factorRorc
ModelRORG_MOUSE.H11DI.0.B
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length13
Quality
B
Motif rank
0
ConsensusndWWvTRRGTCAn
Best auROC (human)
Best auROC (mouse)0.928
Peak sets in benchmark (human)
Peak sets in benchmark (mouse)19
Aligned words504
TF familyThyroid hormone receptor-related factors (NR1) {2.1.2}
TF subfamilyROR (NR1F) {2.1.2.6}
MGIMGI:104856
EntrezGeneGeneID:19885
(SSTAR profile)
UniProt IDRORG_MOUSE
UniProt ACP51450
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 9.71507
0.0005 11.639765
0.0001 15.505025
GTEx tissue expression atlas Rorc expression
Motifs in JASPAR
MA1151.1 (RORC; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0161.011.039.014.053.014.06.029.094.013.050.028.021.018.032.017.0
02180.08.027.014.034.010.01.011.086.04.019.018.060.05.07.016.0
03244.04.012.0100.011.03.00.013.027.05.012.010.022.01.011.025.0
0437.0117.0131.019.02.07.02.02.08.018.08.01.013.056.060.019.0
050.02.05.053.07.05.03.0183.03.09.05.0184.01.02.08.030.0
064.01.06.00.013.01.04.00.016.00.05.00.0201.03.0240.06.0
074.02.0223.05.03.00.00.02.0127.01.0108.019.06.00.00.00.0
081.00.0136.03.01.00.02.00.03.01.0322.05.00.00.026.00.0
090.00.03.02.00.00.00.01.015.042.036.0393.00.00.00.08.0
100.015.00.00.00.041.00.01.00.038.01.00.02.0380.04.018.0
112.00.00.00.0458.01.012.03.05.00.00.00.015.00.00.04.0
1272.0141.0152.0115.00.00.01.00.01.01.03.07.01.04.02.00.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.663-1.0220.219-0.7880.523-0.788-1.6-0.0741.093-0.860.465-0.108-0.392-0.5430.023-0.599
021.741-1.328-0.144-0.7880.083-1.114-3.126-1.0221.004-1.975-0.49-0.5430.646-1.77-1.454-0.658
032.044-1.975-0.9381.155-1.022-2.234-4.4-0.86-0.144-1.77-0.938-1.114-0.346-3.126-1.022-0.22
040.1671.3111.424-0.49-2.584-1.454-2.584-2.584-1.328-0.543-1.328-3.126-0.860.5780.646-0.49
05-4.4-2.584-1.770.523-1.454-1.77-2.2341.757-2.234-1.215-1.771.763-3.126-2.584-1.328-0.04
06-1.975-3.126-1.6-4.4-0.86-3.126-1.975-4.4-0.658-4.4-1.77-4.41.851-2.2342.028-1.6
07-1.975-2.5841.955-1.77-2.234-4.4-4.4-2.5841.393-3.1261.231-0.49-1.6-4.4-4.4-4.4
08-3.126-4.41.461-2.234-3.126-4.4-2.584-4.4-2.234-3.1262.321-1.77-4.4-4.4-0.181-4.4
09-4.4-4.4-2.234-2.584-4.4-4.4-4.4-3.126-0.7210.2930.142.52-4.4-4.4-4.4-1.328
10-4.4-0.721-4.4-4.4-4.40.269-4.4-3.126-4.40.193-3.126-4.4-2.5842.487-1.975-0.543
11-2.584-4.4-4.4-4.42.673-3.126-0.938-2.234-1.77-4.4-4.4-4.4-0.721-4.4-4.4-1.975
120.8281.4971.5721.294-4.4-4.4-3.126-4.4-3.126-3.126-2.234-1.454-3.126-1.975-2.584-4.4