Check the newest release v12
Model info
Transcription factorSPI1
(GeneCards)
ModelSPI1_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length18
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusdvRRWRRGGAAGTGvvvn
Best auROC (human)0.999
Best auROC (mouse)0.999
Peak sets in benchmark (human)80
Peak sets in benchmark (mouse)204
Aligned words495
TF familyEts-related factors {3.5.2}
TF subfamilySpi-like factors {3.5.2.5}
HGNCHGNC:11241
EntrezGeneGeneID:6688
(SSTAR profile)
UniProt IDSPI1_HUMAN
UniProt ACP17947
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 4.89906
0.0005 7.668010000000001
0.0001 13.513760000000001
GTEx tissue expression atlas SPI1 expression
ReMap ChIP-seq dataset list SPI1 datasets
Motifs in JASPAR
MA0080.1 (SPI1; Homo sapiens)
MA0080.2 (SPI1; Homo sapiens)
MA0080.3 (Spi1; Mus musculus)
MA0080.4 (SPI1; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0195.012.095.05.047.010.06.011.077.06.038.08.034.013.023.015.0
02202.05.036.010.019.02.04.016.0130.04.018.010.014.04.08.013.0
03315.08.030.012.09.05.01.00.039.08.017.02.018.03.016.012.0
04296.00.017.068.016.00.01.07.035.03.018.08.05.00.02.019.0
0550.028.0269.05.01.02.00.00.011.03.023.01.015.02.083.02.0
0634.03.038.02.029.01.05.00.0261.034.075.05.05.00.03.00.0
070.00.0329.00.029.00.09.00.011.00.0110.00.02.00.05.00.0
080.00.042.00.00.00.00.00.00.00.0453.00.00.00.00.00.0
090.00.00.00.00.00.00.00.0495.00.00.00.00.00.00.00.0
10492.00.00.03.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
1116.086.0388.02.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.03.00.0
120.01.00.015.04.01.00.081.02.016.05.0368.00.00.00.02.0
130.00.06.00.00.012.06.00.01.01.03.00.01.033.0431.01.0
141.00.01.00.024.06.08.08.0227.072.0111.036.00.01.00.00.0
15158.015.065.014.025.016.07.031.024.033.049.014.04.012.020.08.0
16162.013.023.013.030.020.03.023.049.043.035.014.09.015.023.020.0
1732.0109.084.025.030.018.09.034.029.018.020.017.017.018.018.017.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
011.114-0.9281.114-1.760.414-1.104-1.59-1.0120.904-1.590.203-1.3180.093-0.85-0.292-0.711
021.866-1.760.15-1.104-0.48-2.574-1.966-0.6481.426-1.966-0.533-1.104-0.778-1.966-1.318-0.85
032.309-1.318-0.03-0.928-1.205-1.76-3.117-4.3920.229-1.318-0.589-2.574-0.533-2.224-0.648-0.928
042.247-4.392-0.5890.781-0.648-4.392-3.117-1.4450.122-2.224-0.533-1.318-1.76-4.392-2.574-0.48
050.475-0.0982.152-1.76-3.117-2.574-4.392-4.392-1.012-2.224-0.292-3.117-0.711-2.5740.979-2.574
060.093-2.2240.203-2.574-0.064-3.117-1.76-4.3922.1220.0930.878-1.76-1.76-4.392-2.224-4.392
07-4.392-4.3922.353-4.392-0.064-4.392-1.205-4.392-1.012-4.3921.26-4.392-2.574-4.392-1.76-4.392
08-4.392-4.3920.302-4.392-4.392-4.392-4.392-4.392-4.392-4.3922.672-4.392-4.392-4.392-4.392-4.392
09-4.392-4.392-4.392-4.392-4.392-4.392-4.392-4.3922.761-4.392-4.392-4.392-4.392-4.392-4.392-4.392
102.755-4.392-4.392-2.224-4.392-4.392-4.392-4.392-4.392-4.392-4.392-4.392-4.392-4.392-4.392-4.392
11-0.6481.0142.518-2.574-4.392-4.392-4.392-4.392-4.392-4.392-4.392-4.392-4.392-4.392-2.224-4.392
12-4.392-3.117-4.392-0.711-1.966-3.117-4.3920.955-2.574-0.648-1.762.465-4.392-4.392-4.392-2.574
13-4.392-4.392-1.59-4.392-4.392-0.928-1.59-4.392-3.117-3.117-2.224-4.392-3.1170.0642.623-3.117
14-3.117-4.392-3.117-4.392-0.25-1.59-1.318-1.3181.9820.8381.2690.15-4.392-3.117-4.392-4.392
151.621-0.7110.736-0.778-0.21-0.648-1.4450.002-0.250.0640.455-0.778-1.966-0.928-0.429-1.318
161.646-0.85-0.292-0.85-0.03-0.429-2.224-0.2920.4550.3260.122-0.778-1.205-0.711-0.292-0.429
170.0331.250.991-0.21-0.03-0.533-1.2050.093-0.064-0.533-0.429-0.589-0.589-0.533-0.533-0.589