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Model info
Transcription factorSTAT2
(GeneCards)
ModelSTAT2_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length20
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusndvRRAAhnGAAASYdRRWn
Best auROC (human)0.982
Best auROC (mouse)0.995
Peak sets in benchmark (human)11
Peak sets in benchmark (mouse)8
Aligned words500
TF familySTAT factors {6.2.1}
TF subfamilySTAT2 {6.2.1.0.2}
HGNCHGNC:11363
EntrezGeneGeneID:6773
(SSTAR profile)
UniProt IDSTAT2_HUMAN
UniProt ACP52630
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 7.721910000000001
0.0005 10.32151
0.0001 15.734060000000001
GTEx tissue expression atlas STAT2 expression
ReMap ChIP-seq dataset list STAT2 datasets
Motifs in JASPAR
MA0517.1 (STAT1::STAT2; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0166.023.050.013.081.016.010.026.031.010.044.011.024.014.057.024.0
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147.03.00.014.031.059.02.0229.016.031.05.097.00.03.00.03.0
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1683.09.015.06.026.03.02.07.0222.010.014.010.068.06.010.09.0
17280.024.062.033.014.05.00.09.019.06.013.03.07.08.011.06.0
18226.026.041.027.016.012.04.011.045.010.011.020.016.010.011.014.0
1952.0115.0112.024.023.08.04.023.020.020.016.011.06.017.030.019.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.741-0.3020.465-0.860.945-0.658-1.114-0.181-0.008-1.1140.339-1.022-0.26-0.7880.595-0.26
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072.1120.957-0.0741.231-1.77-2.584-4.4-4.4-3.126-2.234-4.4-2.584-2.584-3.126-2.584-2.584
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112.714-4.4-1.975-4.4-1.6-4.4-4.4-4.4-1.114-4.4-4.4-4.4-2.234-4.4-4.4-4.4
122.751-4.4-4.4-3.126-4.4-4.4-4.4-4.4-1.975-4.4-4.4-4.4-4.4-4.4-4.4-4.4
13-0.3022.3181.552-1.6-4.4-4.4-4.4-4.4-4.4-4.4-4.4-4.4-3.126-4.4-4.4-4.4
14-1.454-2.234-4.4-0.788-0.0080.63-2.5841.981-0.658-0.008-1.771.124-4.4-2.234-4.4-2.234
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