We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorStat2
ModelSTAT2_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length21
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnvvRRAAhnGAAASYRRRdnn
Best auROC (human)0.981
Best auROC (mouse)0.994
Peak sets in benchmark (human)11
Peak sets in benchmark (mouse)8
Aligned words509
TF familySTAT factors {6.2.1}
TF subfamilySTAT2 {6.2.1.0.2}
MGIMGI:103039
EntrezGene
UniProt IDSTAT2_MOUSE
UniProt ACQ9WVL2
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 7.73071
0.0005 10.19061
0.0001 15.35841
GTEx tissue expression atlas Stat2 expression
Motifs in JASPAR
MA0517.1 (STAT1::STAT2; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0146.024.059.017.058.019.010.026.023.014.055.09.040.015.061.016.0
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141.03.03.018.040.053.01.0239.016.025.09.079.00.02.00.03.0
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1658.07.026.011.020.01.00.08.0227.014.024.019.057.01.08.011.0
17265.019.045.033.09.02.01.011.038.09.09.02.012.013.018.06.0
18240.027.039.018.013.08.03.019.032.06.015.020.011.010.023.08.0
1951.0122.0105.018.014.012.04.021.030.020.018.012.011.014.022.018.0
2026.022.029.029.042.055.08.063.046.033.018.052.013.024.019.013.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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122.738-2.568-3.111-2.218-4.387-4.387-4.387-4.387-1.754-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387
13-0.2442.3591.417-1.754-3.111-3.111-4.387-4.387-4.387-3.111-4.387-4.387-4.387-2.568-3.111-4.387
14-3.111-2.218-2.218-0.5270.260.539-3.1112.04-0.642-0.204-1.1990.936-4.387-2.568-4.387-2.218
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