We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorTCF7
(GeneCards)
ModelTCF7_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length17
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnvnnvRSWTSAAAGvvn
Best auROC (human)0.871
Best auROC (mouse)0.926
Peak sets in benchmark (human)7
Peak sets in benchmark (mouse)19
Aligned words213
TF familyTCF-7-related factors {4.1.3}
TF subfamilyTCF-7 (TCF-1) [1] {4.1.3.0.1}
HGNCHGNC:11639
EntrezGeneGeneID:6932
(SSTAR profile)
UniProt IDTCF7_HUMAN
UniProt ACP36402
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 10.458760000000002
0.0005 12.28096
0.0001 16.03001
GTEx tissue expression atlas TCF7 expression
ReMap ChIP-seq dataset list TCF7 datasets
Motifs in JASPAR
MA0769.1 (Tcf7; Mus musculus)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0135.04.023.010.016.09.010.06.014.010.019.00.014.08.020.05.0
0229.010.029.011.09.015.04.03.019.021.022.010.04.05.08.04.0
0314.034.07.06.021.020.02.08.032.013.012.06.09.09.04.06.0
0433.012.028.03.017.046.05.08.06.011.08.00.09.04.011.02.0
0544.06.06.09.059.04.07.03.039.02.010.01.09.02.01.01.0
061.088.061.01.00.013.01.00.01.010.010.03.00.010.04.00.0
071.00.00.01.079.08.01.033.057.00.04.015.02.00.01.01.0
089.02.00.0128.01.00.00.07.02.00.01.03.09.01.01.039.0
091.015.04.01.00.02.01.00.00.02.00.00.021.0129.024.03.0
1019.01.01.01.0144.01.01.02.029.00.00.00.04.00.00.00.0
11166.022.08.00.02.00.00.00.02.00.00.00.03.00.00.00.0
12163.00.04.06.019.00.00.03.08.00.00.00.00.00.00.00.0
1312.011.0166.01.00.00.00.00.00.00.04.00.02.01.05.01.0
142.00.011.01.08.00.04.00.051.024.087.013.01.00.01.00.0
1514.020.023.05.06.013.02.03.027.037.029.010.04.06.04.00.0
1622.08.016.05.029.021.011.015.021.014.013.010.02.04.06.06.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.998-1.10.583-0.2310.227-0.333-0.231-0.7210.096-0.2310.395-3.6690.096-0.4460.446-0.893
020.812-0.2310.812-0.139-0.3330.163-1.1-1.3630.3950.4940.54-0.231-1.1-0.893-0.446-1.1
030.0960.97-0.574-0.7210.4940.446-1.72-0.4460.910.024-0.054-0.721-0.333-0.333-1.1-0.721
040.94-0.0540.778-1.3630.2861.269-0.893-0.446-0.721-0.139-0.446-3.669-0.333-1.1-0.139-1.72
051.225-0.721-0.721-0.3331.517-1.1-0.574-1.3631.106-1.72-0.231-2.28-0.333-1.72-2.28-2.28
06-2.281.9151.55-2.28-3.6690.024-2.28-3.669-2.28-0.231-0.231-1.363-3.669-0.231-1.1-3.669
07-2.28-3.669-3.669-2.281.807-0.446-2.280.941.482-3.669-1.10.163-1.72-3.669-2.28-2.28
08-0.333-1.72-3.6692.288-2.28-3.669-3.669-0.574-1.72-3.669-2.28-1.363-0.333-2.28-2.281.106
09-2.280.163-1.1-2.28-3.669-1.72-2.28-3.669-3.669-1.72-3.669-3.6690.4942.2960.625-1.363
100.395-2.28-2.28-2.282.406-2.28-2.28-1.720.812-3.669-3.669-3.669-1.1-3.669-3.669-3.669
112.5480.54-0.446-3.669-1.72-3.669-3.669-3.669-1.72-3.669-3.669-3.669-1.363-3.669-3.669-3.669
122.529-3.669-1.1-0.7210.395-3.669-3.669-1.363-0.446-3.669-3.669-3.669-3.669-3.669-3.669-3.669
13-0.054-0.1392.548-2.28-3.669-3.669-3.669-3.669-3.669-3.669-1.1-3.669-1.72-2.28-0.893-2.28
14-1.72-3.669-0.139-2.28-0.446-3.669-1.1-3.6691.3720.6251.9030.024-2.28-3.669-2.28-3.669
150.0960.4460.583-0.893-0.7210.024-1.72-1.3630.7421.0530.812-0.231-1.1-0.721-1.1-3.669
160.54-0.4460.227-0.8930.8120.494-0.1390.1630.4940.0960.024-0.231-1.72-1.1-0.721-0.721