Check the newest release v13
Model info
Transcription factorTCF7
(GeneCards)
ModelTCF7_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length17
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnvnnvRSWTSAAAGvvn
Best auROC (human)0.871
Best auROC (mouse)0.926
Peak sets in benchmark (human)7
Peak sets in benchmark (mouse)19
Aligned words213
TF familyTCF-7-related factors {4.1.3}
TF subfamilyTCF-7 (TCF-1) [1] {4.1.3.0.1}
HGNCHGNC:11639
EntrezGeneGeneID:6932
(SSTAR profile)
UniProt IDTCF7_HUMAN
UniProt ACP36402
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 10.458760000000002
0.0005 12.28096
0.0001 16.03001
GTEx tissue expression atlas TCF7 expression
ReMap ChIP-seq dataset list TCF7 datasets
Motifs in JASPAR
MA0769.1 (Tcf7; Mus musculus)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0135.04.023.010.016.09.010.06.014.010.019.00.014.08.020.05.0
0229.010.029.011.09.015.04.03.019.021.022.010.04.05.08.04.0
0314.034.07.06.021.020.02.08.032.013.012.06.09.09.04.06.0
0433.012.028.03.017.046.05.08.06.011.08.00.09.04.011.02.0
0544.06.06.09.059.04.07.03.039.02.010.01.09.02.01.01.0
061.088.061.01.00.013.01.00.01.010.010.03.00.010.04.00.0
071.00.00.01.079.08.01.033.057.00.04.015.02.00.01.01.0
089.02.00.0128.01.00.00.07.02.00.01.03.09.01.01.039.0
091.015.04.01.00.02.01.00.00.02.00.00.021.0129.024.03.0
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11166.022.08.00.02.00.00.00.02.00.00.00.03.00.00.00.0
12163.00.04.06.019.00.00.03.08.00.00.00.00.00.00.00.0
1312.011.0166.01.00.00.00.00.00.00.04.00.02.01.05.01.0
142.00.011.01.08.00.04.00.051.024.087.013.01.00.01.00.0
1514.020.023.05.06.013.02.03.027.037.029.010.04.06.04.00.0
1622.08.016.05.029.021.011.015.021.014.013.010.02.04.06.06.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.998-1.10.583-0.2310.227-0.333-0.231-0.7210.096-0.2310.395-3.6690.096-0.4460.446-0.893
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030.0960.97-0.574-0.7210.4940.446-1.72-0.4460.910.024-0.054-0.721-0.333-0.333-1.1-0.721
040.94-0.0540.778-1.3630.2861.269-0.893-0.446-0.721-0.139-0.446-3.669-0.333-1.1-0.139-1.72
051.225-0.721-0.721-0.3331.517-1.1-0.574-1.3631.106-1.72-0.231-2.28-0.333-1.72-2.28-2.28
06-2.281.9151.55-2.28-3.6690.024-2.28-3.669-2.28-0.231-0.231-1.363-3.669-0.231-1.1-3.669
07-2.28-3.669-3.669-2.281.807-0.446-2.280.941.482-3.669-1.10.163-1.72-3.669-2.28-2.28
08-0.333-1.72-3.6692.288-2.28-3.669-3.669-0.574-1.72-3.669-2.28-1.363-0.333-2.28-2.281.106
09-2.280.163-1.1-2.28-3.669-1.72-2.28-3.669-3.669-1.72-3.669-3.6690.4942.2960.625-1.363
100.395-2.28-2.28-2.282.406-2.28-2.28-1.720.812-3.669-3.669-3.669-1.1-3.669-3.669-3.669
112.5480.54-0.446-3.669-1.72-3.669-3.669-3.669-1.72-3.669-3.669-3.669-1.363-3.669-3.669-3.669
122.529-3.669-1.1-0.7210.395-3.669-3.669-1.363-0.446-3.669-3.669-3.669-3.669-3.669-3.669-3.669
13-0.054-0.1392.548-2.28-3.669-3.669-3.669-3.669-3.669-3.669-1.1-3.669-1.72-2.28-0.893-2.28
14-1.72-3.669-0.139-2.28-0.446-3.669-1.1-3.6691.3720.6251.9030.024-2.28-3.669-2.28-3.669
150.0960.4460.583-0.893-0.7210.024-1.72-1.3630.7421.0530.812-0.231-1.1-0.721-1.1-3.669
160.54-0.4460.227-0.8930.8120.494-0.1390.1630.4940.0960.024-0.231-1.72-1.1-0.721-0.721