We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorTFE3
(GeneCards)
ModelTFE3_HUMAN.H11DI.0.B
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length12
Quality
B
Motif rank
0
ConsensusndGTCAYGTGAb
Best auROC (human)0.503
Best auROC (mouse)1.0
Peak sets in benchmark (human)2
Peak sets in benchmark (mouse)30
Aligned words437
TF familybHLH-ZIP factors {1.2.6}
TF subfamilyTFE3-like factors {1.2.6.1}
HGNCHGNC:11752
EntrezGeneGeneID:7030
(SSTAR profile)
UniProt IDTFE3_HUMAN
UniProt ACP19532
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 5.90812
0.0005 8.042575
0.0001 12.45884
GTEx tissue expression atlas TFE3 expression
ReMap ChIP-seq dataset list TFE3 datasets
Motifs in JASPAR
MA0831.1 (TFE3; Homo sapiens)
MA0831.2 (TFE3; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0144.00.060.010.025.014.026.020.038.02.066.022.022.00.049.07.0
029.02.0117.01.06.00.010.00.042.05.0152.02.04.00.055.00.0
034.03.010.044.03.00.00.04.010.013.030.0281.01.00.01.01.0
040.018.00.00.00.016.00.00.00.041.00.00.00.0329.00.01.0
050.00.00.00.0382.02.01.019.00.00.00.00.00.01.00.00.0
060.0268.012.0102.00.01.00.02.00.00.00.01.00.012.02.05.0
070.00.00.00.018.06.0256.01.00.05.08.01.04.01.0105.00.0
081.02.01.018.00.01.00.011.011.05.011.0342.00.00.00.02.0
090.01.011.00.00.00.07.01.00.00.012.00.01.00.0371.01.0
100.01.00.00.00.01.00.00.0322.031.039.09.02.00.00.00.0
114.0155.044.0121.08.04.06.015.07.08.014.010.00.03.05.01.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.547-4.2260.855-0.907-0.012-0.5810.026-0.2320.401-2.3810.949-0.138-0.138-4.2260.653-1.248
02-1.008-2.3811.519-2.927-1.394-4.226-0.907-4.2260.501-1.5641.78-2.381-1.77-4.2260.768-4.226
03-1.77-2.03-0.9070.547-2.03-4.226-4.226-1.77-0.907-0.6530.1682.394-2.927-4.226-2.927-2.927
04-4.226-0.335-4.226-4.226-4.226-0.45-4.226-4.226-4.2260.477-4.226-4.226-4.2262.551-4.226-2.927
05-4.226-4.226-4.226-4.2262.7-2.381-2.927-0.282-4.226-4.226-4.226-4.226-4.226-2.927-4.226-4.226
06-4.2262.346-0.731.383-4.226-2.927-4.226-2.381-4.226-4.226-4.226-2.927-4.226-0.73-2.381-1.564
07-4.226-4.226-4.226-4.226-0.335-1.3942.301-2.927-4.226-1.564-1.121-2.927-1.77-2.9271.412-4.226
08-2.927-2.381-2.927-0.335-4.226-2.927-4.226-0.815-0.815-1.564-0.8152.59-4.226-4.226-4.226-2.381
09-4.226-2.927-0.815-4.226-4.226-4.226-1.248-2.927-4.226-4.226-0.73-4.226-2.927-4.2262.671-2.927
10-4.226-2.927-4.226-4.226-4.226-2.927-4.226-4.2262.530.20.427-1.008-2.381-4.226-4.226-4.226
11-1.771.80.5471.553-1.121-1.77-1.394-0.513-1.248-1.121-0.581-0.907-4.226-2.03-1.564-2.927