We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorTHAP11
(GeneCards)
ModelTHA11_HUMAN.H11DI.0.B
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length25
Quality
B
Motif rank
0
ConsensusSCdnKGSMTbCTGGGAvdTGTAGTY
Best auROC (human)0.95
Best auROC (mouse)0.74
Peak sets in benchmark (human)2
Peak sets in benchmark (mouse)2
Aligned words107
TF familyTHAP-related factors {2.9.1}
TF subfamilyTHAP11 (HRIHFB2206) {2.9.1.0.11}
HGNCHGNC:23194
EntrezGeneGeneID:57215
(SSTAR profile)
UniProt IDTHA11_HUMAN
UniProt ACQ96EK4
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -5.13909
0.0005 -2.35639
0.0001 3.76286
GTEx tissue expression atlas THAP11 expression
ReMap ChIP-seq dataset list THAP11 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.08.00.00.01.024.04.03.00.057.00.03.00.05.00.02.0
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051.01.012.01.00.00.03.00.02.02.045.07.00.00.033.00.0
060.03.00.00.00.02.01.00.07.073.09.04.00.03.03.02.0
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190.00.01.00.00.00.012.00.00.00.02.00.00.00.092.00.0
200.00.00.00.00.00.00.00.01.00.05.0101.00.00.00.00.0
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230.00.00.00.00.00.00.00.00.01.01.0105.00.00.00.00.0
240.00.00.00.00.00.00.01.00.00.01.00.05.042.02.056.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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02-1.687-3.174-3.174-3.1741.702-0.2771.7780.388-1.114-1.114-3.174-3.174-1.687-1.687-0.104-3.174
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09-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-0.2770.172-0.277-3.174-3.174-1.687-1.687-0.7510.9071.6491.5
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12-3.174-3.174-1.687-3.174-3.174-3.1740.784-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.1742.56-1.687
13-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-1.687-3.1742.714-3.174-3.174-3.174-1.687-3.174
14-3.174-3.174-1.687-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-0.277-3.1742.665-1.687-3.174-3.174-3.174-3.174
15-0.277-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.1742.582-1.687-0.486-0.486-1.687-3.174-3.174-3.174
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20-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-1.687-3.174-0.2772.675-3.174-3.174-3.174-3.174
21-1.687-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-0.277-3.174-3.174-3.1742.635-3.174-0.486-3.174
22-3.174-3.1742.695-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-0.486-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174
23-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-1.687-1.6872.714-3.174-3.174-3.174-3.174
24-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-1.687-3.174-3.174-1.687-3.174-0.2771.802-1.1142.088