We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorThap11
ModelTHA11_MOUSE.H11DI.0.B
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length25
Quality
B
Motif rank
0
ConsensusSCdnKGSMTbCTGGGAvdTGTAGTY
Best auROC (human)0.95
Best auROC (mouse)0.74
Peak sets in benchmark (human)2
Peak sets in benchmark (mouse)2
Aligned words107
TF familyTHAP-related factors {2.9.1}
TF subfamilyTHAP11 (HRIHFB2206) {2.9.1.0.11}
MGIMGI:1930964
EntrezGeneGeneID:59016
(SSTAR profile)
UniProt IDTHA11_MOUSE
UniProt ACQ9JJD0
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -4.9153400000000005
0.0005 -2.12114
0.0001 4.02121
GTEx tissue expression atlas Thap11 expression
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.08.00.00.01.024.04.03.00.057.00.03.00.05.00.02.0
021.00.00.00.038.05.041.010.02.02.00.00.01.01.06.00.0
037.08.019.08.02.02.01.03.010.017.014.06.03.03.02.02.0
042.02.012.06.06.00.013.011.04.01.023.08.03.00.08.08.0
051.01.012.01.00.00.03.00.02.02.045.07.00.00.033.00.0
060.03.00.00.00.02.01.00.07.073.09.04.00.03.03.02.0
074.01.01.01.041.031.01.08.02.08.00.03.03.01.01.01.0
080.010.00.040.00.04.01.036.00.00.00.03.00.04.01.08.0
090.00.00.00.00.05.08.05.00.00.01.01.03.017.036.031.0
101.01.00.01.00.020.00.02.02.041.01.01.01.033.02.01.0
110.02.00.02.01.012.00.082.00.01.00.02.00.00.00.05.0
120.00.01.00.00.00.015.00.00.00.00.00.00.00.090.01.0
130.00.00.00.00.00.00.00.01.00.0105.00.00.00.01.00.0
140.00.01.00.00.00.00.00.05.00.0100.01.00.00.00.00.0
155.00.00.00.00.00.00.00.092.01.04.04.01.00.00.00.0
1640.08.044.06.00.01.00.00.01.01.01.01.03.00.00.01.0
1720.05.05.014.01.00.00.09.08.04.04.029.01.00.02.05.0
180.03.00.027.00.01.00.08.00.03.00.08.01.05.02.049.0
190.00.01.00.00.00.012.00.00.00.02.00.00.00.092.00.0
200.00.00.00.00.00.00.00.01.00.05.0101.00.00.00.00.0
211.00.00.00.00.00.00.00.05.00.00.00.097.00.04.00.0
220.00.0103.00.00.00.00.00.00.00.04.00.00.00.00.00.0
230.00.00.00.00.00.00.00.00.01.01.0105.00.00.00.00.0
240.00.00.00.00.00.00.01.00.00.01.00.05.042.02.056.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-3.1740.172-3.174-3.174-1.6871.247-0.486-0.751-3.1742.105-3.174-0.751-3.174-0.277-3.174-1.114
02-1.687-3.174-3.174-3.1741.702-0.2771.7780.388-1.114-1.114-3.174-3.174-1.687-1.687-0.104-3.174
030.0440.1721.0170.172-1.114-1.114-1.687-0.7510.3880.9070.717-0.104-0.751-0.751-1.114-1.114
04-1.114-1.1140.566-0.104-0.104-3.1740.6440.481-0.486-1.6871.2050.172-0.751-3.1740.1720.172
05-1.687-1.6870.566-1.687-3.174-3.174-0.751-3.174-1.114-1.1141.870.044-3.174-3.1741.562-3.174
06-3.174-0.751-3.174-3.174-3.174-1.114-1.687-3.1740.0442.3510.286-0.486-3.174-0.751-0.751-1.114
07-0.486-1.687-1.687-1.6871.7781.5-1.6870.172-1.1140.172-3.174-0.751-0.751-1.687-1.687-1.687
08-3.1740.388-3.1741.753-3.174-0.486-1.6871.649-3.174-3.174-3.174-0.751-3.174-0.486-1.6870.172
09-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-0.2770.172-0.277-3.174-3.174-1.687-1.687-0.7510.9071.6491.5
10-1.687-1.687-3.174-1.687-3.1741.067-3.174-1.114-1.1141.778-1.687-1.687-1.6871.562-1.114-1.687
11-3.174-1.114-3.174-1.114-1.6870.566-3.1742.467-3.174-1.687-3.174-1.114-3.174-3.174-3.174-0.277
12-3.174-3.174-1.687-3.174-3.174-3.1740.784-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.1742.56-1.687
13-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-1.687-3.1742.714-3.174-3.174-3.174-1.687-3.174
14-3.174-3.174-1.687-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-0.277-3.1742.665-1.687-3.174-3.174-3.174-3.174
15-0.277-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.1742.582-1.687-0.486-0.486-1.687-3.174-3.174-3.174
161.7530.1721.848-0.104-3.174-1.687-3.174-3.174-1.687-1.687-1.687-1.687-0.751-3.174-3.174-1.687
171.067-0.277-0.2770.717-1.687-3.174-3.1740.2860.172-0.486-0.4861.434-1.687-3.174-1.114-0.277
18-3.174-0.751-3.1741.364-3.174-1.687-3.1740.172-3.174-0.751-3.1740.172-1.687-0.277-1.1141.955
19-3.174-3.174-1.687-3.174-3.174-3.1740.566-3.174-3.174-3.174-1.114-3.174-3.174-3.1742.582-3.174
20-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-1.687-3.174-0.2772.675-3.174-3.174-3.174-3.174
21-1.687-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-0.277-3.174-3.174-3.1742.635-3.174-0.486-3.174
22-3.174-3.1742.695-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-0.486-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174
23-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-1.687-1.6872.714-3.174-3.174-3.174-3.174
24-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-3.174-1.687-3.174-3.174-1.687-3.174-0.2771.802-1.1142.088