We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorZBTB18
(GeneCards)
ModelZBT18_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length16
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusbKCCAGMYGWKbvbvn
Best auROC (human)0.909
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words321
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyZNF238-like factors {2.3.3.16}
HGNCHGNC:13030
EntrezGeneGeneID:10472
(SSTAR profile)
UniProt IDZBT18_HUMAN
UniProt ACQ99592
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 6.43801
0.0005 8.67806
0.0001 13.22586
GTEx tissue expression atlas ZBTB18 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZBTB18 datasets
Motifs in JASPAR
MA0698.1 (ZBTB18; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
013.04.018.018.06.08.08.030.03.017.021.07.02.07.04.092.0
021.09.04.00.06.022.08.00.05.035.011.00.010.0124.013.00.0
030.022.00.00.00.0190.00.00.00.036.00.00.00.00.00.00.0
040.00.00.00.0245.00.00.03.00.00.00.00.00.00.00.00.0
050.00.0180.065.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.03.00.0
060.00.00.00.00.00.00.00.077.0104.01.01.00.00.00.065.0
070.01.010.066.01.02.07.094.00.00.01.00.00.061.02.03.0
080.00.01.00.00.025.039.00.00.00.020.00.00.02.0161.00.0
090.00.00.00.018.02.00.07.038.054.04.0125.00.00.00.00.0
100.00.010.046.01.07.022.026.00.01.03.00.02.05.068.057.0
110.00.02.01.03.03.07.00.08.032.049.014.08.018.025.078.0
124.05.08.02.07.024.012.010.018.030.027.08.01.076.010.06.0
133.014.011.02.014.092.012.017.07.021.020.09.02.08.012.04.0
145.05.016.00.081.021.020.013.09.018.022.06.07.013.09.03.0
158.08.022.064.018.024.08.07.07.030.020.010.00.010.06.06.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-1.555-1.2940.1470.147-0.915-0.641-0.6410.65-1.5550.090.298-0.769-1.911-0.769-1.2941.763
02-2.467-0.528-1.294-3.828-0.9150.344-0.641-3.828-1.0870.802-0.334-3.828-0.4262.06-0.172-3.828
03-3.8280.344-3.828-3.828-3.8282.486-3.828-3.828-3.8280.83-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828
04-3.828-3.828-3.828-3.8282.74-3.828-3.828-1.555-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828
05-3.828-3.8282.4321.417-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-1.555-3.828
06-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-3.8281.5851.885-2.467-2.467-3.828-3.828-3.8281.417
07-3.828-2.467-0.4261.432-2.467-1.911-0.7691.784-3.828-3.828-2.467-3.828-3.8281.354-1.911-1.555
08-3.828-3.828-2.467-3.828-3.8280.470.91-3.828-3.828-3.8280.25-3.828-3.828-1.9112.321-3.828
09-3.828-3.828-3.828-3.8280.147-1.911-3.828-0.7690.8841.233-1.2942.068-3.828-3.828-3.828-3.828
10-3.828-3.828-0.4261.073-2.467-0.7690.3440.508-3.828-2.467-1.555-3.828-1.911-1.0871.4621.286
11-3.828-3.828-1.911-2.467-1.555-1.555-0.769-3.828-0.6410.7141.136-0.099-0.6410.1470.471.598
12-1.294-1.087-0.641-1.911-0.7690.429-0.25-0.4260.1470.650.546-0.641-2.4671.572-0.426-0.915
13-1.555-0.099-0.334-1.911-0.0991.763-0.250.09-0.7690.2980.25-0.528-1.911-0.641-0.25-1.294
14-1.087-1.0870.031-3.8281.6360.2980.25-0.172-0.5280.1470.344-0.915-0.769-0.172-0.528-1.555
15-0.641-0.6410.3441.4010.1470.429-0.641-0.769-0.7690.650.25-0.426-3.828-0.426-0.915-0.915