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Model info
Transcription factorZBTB18
(GeneCards)
ModelZBT18_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length16
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusbKCCAGMYGWKbvbvn
Best auROC (human)0.909
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words321
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyZNF238-like factors {2.3.3.16}
HGNCHGNC:13030
EntrezGeneGeneID:10472
(SSTAR profile)
UniProt IDZBT18_HUMAN
UniProt ACQ99592
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 6.43801
0.0005 8.67806
0.0001 13.22586
GTEx tissue expression atlas ZBTB18 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZBTB18 datasets
Motifs in JASPAR
MA0698.1 (ZBTB18; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
013.04.018.018.06.08.08.030.03.017.021.07.02.07.04.092.0
021.09.04.00.06.022.08.00.05.035.011.00.010.0124.013.00.0
030.022.00.00.00.0190.00.00.00.036.00.00.00.00.00.00.0
040.00.00.00.0245.00.00.03.00.00.00.00.00.00.00.00.0
050.00.0180.065.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.03.00.0
060.00.00.00.00.00.00.00.077.0104.01.01.00.00.00.065.0
070.01.010.066.01.02.07.094.00.00.01.00.00.061.02.03.0
080.00.01.00.00.025.039.00.00.00.020.00.00.02.0161.00.0
090.00.00.00.018.02.00.07.038.054.04.0125.00.00.00.00.0
100.00.010.046.01.07.022.026.00.01.03.00.02.05.068.057.0
110.00.02.01.03.03.07.00.08.032.049.014.08.018.025.078.0
124.05.08.02.07.024.012.010.018.030.027.08.01.076.010.06.0
133.014.011.02.014.092.012.017.07.021.020.09.02.08.012.04.0
145.05.016.00.081.021.020.013.09.018.022.06.07.013.09.03.0
158.08.022.064.018.024.08.07.07.030.020.010.00.010.06.06.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-1.555-1.2940.1470.147-0.915-0.641-0.6410.65-1.5550.090.298-0.769-1.911-0.769-1.2941.763
02-2.467-0.528-1.294-3.828-0.9150.344-0.641-3.828-1.0870.802-0.334-3.828-0.4262.06-0.172-3.828
03-3.8280.344-3.828-3.828-3.8282.486-3.828-3.828-3.8280.83-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828
04-3.828-3.828-3.828-3.8282.74-3.828-3.828-1.555-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828
05-3.828-3.8282.4321.417-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-1.555-3.828
06-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-3.828-3.8281.5851.885-2.467-2.467-3.828-3.828-3.8281.417
07-3.828-2.467-0.4261.432-2.467-1.911-0.7691.784-3.828-3.828-2.467-3.828-3.8281.354-1.911-1.555
08-3.828-3.828-2.467-3.828-3.8280.470.91-3.828-3.828-3.8280.25-3.828-3.828-1.9112.321-3.828
09-3.828-3.828-3.828-3.8280.147-1.911-3.828-0.7690.8841.233-1.2942.068-3.828-3.828-3.828-3.828
10-3.828-3.828-0.4261.073-2.467-0.7690.3440.508-3.828-2.467-1.555-3.828-1.911-1.0871.4621.286
11-3.828-3.828-1.911-2.467-1.555-1.555-0.769-3.828-0.6410.7141.136-0.099-0.6410.1470.471.598
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13-1.555-0.099-0.334-1.911-0.0991.763-0.250.09-0.7690.2980.25-0.528-1.911-0.641-0.25-1.294
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