Check the newest release v13
Model info
Transcription factorZEB1
(GeneCards)
ModelZEB1_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length11
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusbvCAGGTGhRb
Best auROC (human)0.951
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)12
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words644
TF familyHD-ZF factors {3.1.8}
TF subfamilyZEB {3.1.8.3}
HGNCHGNC:11642
EntrezGeneGeneID:6935
(SSTAR profile)
UniProt IDZEB1_HUMAN
UniProt ACP37275
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 5.657109999999999
0.0005 8.941600000000001
0.0001 15.147215000000001
GTEx tissue expression atlas ZEB1 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZEB1 datasets
Motifs in JASPAR
MA0103.1 (ZEB1; Gallus gallus)
MA0103.2 (ZEB1; Homo sapiens)
MA0103.3 (ZEB1; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0117.013.025.01.075.048.037.027.068.065.028.07.017.018.039.07.0
023.0172.01.01.01.0143.00.00.00.0128.00.01.00.041.01.00.0
034.00.00.00.0484.00.00.00.02.00.00.00.02.00.00.00.0
041.00.0491.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0
050.00.01.00.00.00.00.00.00.00.0491.00.00.00.00.00.0
060.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0492.00.00.00.00.0
070.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.00.0105.00.0383.04.0
0853.013.030.09.00.00.00.00.0190.066.030.097.03.00.00.01.0
0938.019.0184.05.019.08.046.06.016.07.037.00.011.06.087.03.0
1014.024.034.012.07.07.05.021.040.0106.0142.066.04.02.05.03.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.583-0.844-0.204-3.1110.8840.4410.183-0.1280.7870.742-0.092-1.439-0.583-0.5270.235-1.439
02-2.2181.711-3.111-3.111-3.1111.527-4.387-4.387-4.3871.417-4.387-3.111-4.3870.285-3.111-4.387
03-1.96-4.387-4.387-4.3872.744-4.387-4.387-4.387-2.568-4.387-4.387-4.387-2.568-4.387-4.387-4.387
04-3.111-4.3872.759-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387
05-4.387-4.387-3.111-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.3872.759-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387
06-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.3872.761-4.387-4.387-4.387-4.387
07-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.387-4.3871.219-4.3872.511-1.96
080.539-0.844-0.024-1.199-4.387-4.387-4.387-4.3871.8110.757-0.0241.14-2.218-4.387-4.387-3.111
090.209-0.4741.779-1.754-0.474-1.3120.399-1.584-0.642-1.4390.183-4.387-1.006-1.5841.032-2.218
10-0.772-0.2440.099-0.922-1.439-1.439-1.754-0.3760.261.2291.520.757-1.96-2.568-1.754-2.218