We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorZic3
ModelZIC3_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length18
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusnndShbhCCTGCTGdGhn
Best auROC (human)
Best auROC (mouse)0.953
Peak sets in benchmark (human)
Peak sets in benchmark (mouse)5
Aligned words226
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyGLI-like factors {2.3.3.1}
MGIMGI:106676
EntrezGeneGeneID:22773
(SSTAR profile)
UniProt IDZIC3_MOUSE
UniProt ACQ62521
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 6.43906
0.0005 8.641960000000001
0.0001 13.34121
GTEx tissue expression atlas Zic3 expression
Motifs in JASPAR
MA0697.1 (ZIC3; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
015.023.013.08.020.023.00.011.09.09.013.06.00.05.019.03.0
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PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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