We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorZNF136
(GeneCards)
ModelZN136_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length27
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusTGCTGGRTAYAGWATTCTWGGYTGRCA
Best auROC (human)0.972
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)3
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words100
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyZNF763-like factors {2.3.3.33}
HGNCHGNC:12920
EntrezGeneGeneID:7695
(SSTAR profile)
UniProt IDZN136_HUMAN
UniProt ACP52737
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -5.84684
0.0005 -2.9641400000000004
0.0001 3.33126
GTEx tissue expression atlas ZNF136 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF136 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
011.00.01.01.06.01.00.02.00.00.03.00.03.02.076.04.0
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267.00.00.00.080.00.01.00.00.00.00.00.010.00.01.01.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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03-3.123-1.625-3.123-3.123-1.625-1.05-3.1232.508-3.123-1.05-3.123-3.123-3.123-1.05-3.1230.631
04-3.123-3.123-1.625-3.123-0.422-3.123-3.123-0.687-3.123-3.123-3.123-3.1230.546-1.6252.495-1.625
05-3.123-3.1230.782-1.625-1.625-3.123-3.123-3.1230.109-0.2122.331-1.625-3.123-3.123-0.422-3.123
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09-1.051.533-1.6252.254-3.123-3.123-3.123-3.123-3.123-3.123-3.123-0.422-3.123-1.625-3.123-3.123
10-1.05-3.123-3.123-3.1231.533-3.123-3.123-1.625-1.625-3.123-3.123-3.1232.27-3.123-0.687-3.123
110.709-0.4222.495-3.123-3.123-3.123-3.123-3.123-0.687-3.123-3.123-3.123-3.123-3.123-1.625-3.123
120.631-3.123-3.123-0.422-1.05-3.123-3.123-1.051.714-0.422-0.6871.741-3.123-3.123-3.123-3.123
131.979-3.123-0.687-3.123-0.422-3.123-3.123-3.123-0.687-3.123-3.123-3.1231.818-1.625-1.05-3.123
14-3.123-1.05-0.4222.603-3.123-3.123-3.123-1.625-3.123-3.123-3.123-0.212-3.123-3.123-3.123-3.123
15-3.123-3.123-3.123-3.123-3.123-3.123-3.123-1.05-3.123-3.123-3.123-0.422-1.625-0.422-1.6252.603
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20-3.123-3.1230.351-3.123-3.123-3.123-3.123-3.123-1.05-3.1232.58-1.625-3.123-3.123-1.05-3.123
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22-3.123-3.123-3.123-1.05-3.123-3.123-3.1231.353-3.123-3.123-3.123-1.05-3.123-1.05-0.6872.316
23-3.123-3.123-3.123-3.123-1.625-3.123-3.123-1.625-3.123-3.123-0.687-3.123-1.05-1.6252.614-0.687
24-3.123-3.123-0.687-3.123-1.625-3.123-3.123-3.1232.222-1.051.5-1.625-3.123-3.123-0.422-3.123
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260.109-3.123-3.123-3.1232.508-3.123-1.625-3.123-3.123-3.123-3.123-3.1230.453-3.123-1.625-1.625