We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorZNF143
(GeneCards)
ModelZN143_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length25
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusSYvvdGSMYbMTGGGARdTGTAGTY
Best auROC (human)0.993
Best auROC (mouse)0.987
Peak sets in benchmark (human)28
Peak sets in benchmark (mouse)9
Aligned words386
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyZNF76-like factors {2.3.3.28}
HGNCHGNC:12928
EntrezGeneGeneID:7702
(SSTAR profile)
UniProt IDZN143_HUMAN
UniProt ACP52747
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -6.1740900000000005
0.0005 -3.19034
0.0001 3.33251
GTEx tissue expression atlas ZNF143 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF143 datasets
Motifs in JASPAR
MA0088.1 (znf143; Xenopus laevis)
MA0088.2 (ZNF143; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.013.03.00.013.063.010.018.013.0211.05.012.00.012.05.02.0
029.03.012.02.0109.014.0150.026.05.010.08.00.010.05.017.00.0
0345.019.053.016.010.01.015.06.040.042.080.025.08.07.08.05.0
0420.07.065.011.015.01.032.021.048.06.068.034.010.00.018.024.0
053.00.089.01.00.01.012.01.07.04.0158.014.01.00.084.05.0
061.07.03.00.00.02.03.00.021.0226.080.016.00.012.06.03.0
0713.05.01.03.0123.095.011.018.038.044.02.08.07.08.03.01.0
081.035.017.0128.00.032.03.0117.00.06.01.010.01.05.02.022.0
090.02.00.00.06.011.028.033.01.02.018.02.08.060.0104.0105.0
102.012.00.01.021.043.03.08.011.0124.05.010.06.0100.027.07.0
111.016.00.023.02.029.02.0246.00.06.00.029.00.012.00.014.0
120.00.03.00.00.00.063.00.00.00.02.00.02.00.0309.01.0
130.00.02.00.00.00.00.00.01.00.0376.00.00.00.01.00.0
140.00.01.00.00.00.00.00.02.01.0371.05.00.00.00.00.0
152.00.00.00.01.00.00.00.0342.05.018.07.03.02.00.00.0
16166.026.0135.021.04.02.01.00.06.02.010.00.05.00.02.00.0
17104.09.029.039.03.02.01.024.029.012.010.097.02.01.01.017.0
181.08.06.0123.01.02.02.019.01.09.01.030.03.014.015.0145.0
190.00.06.00.01.00.032.00.00.00.024.00.05.00.0311.01.0
200.01.04.01.00.00.00.00.016.020.014.0323.00.00.00.01.0
2113.00.02.01.016.02.02.01.016.01.01.00.0310.00.014.01.0
221.01.0353.00.01.00.02.00.00.00.019.00.00.01.02.00.0
230.00.01.01.01.00.01.00.00.02.04.0370.00.00.00.00.0
241.00.00.00.01.00.00.01.01.03.01.01.010.0186.09.0166.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-4.174-0.59-1.968-4.174-0.590.966-0.844-0.272-0.592.171-1.502-0.668-4.174-0.668-1.502-2.32
02-0.945-1.968-0.668-2.321.512-0.5181.830.089-1.502-0.844-1.058-4.174-0.844-1.502-0.328-4.174
030.632-0.2190.794-0.388-0.844-2.867-0.451-1.3310.5150.5631.2040.051-1.058-1.186-1.058-1.502
04-0.169-1.1860.997-0.752-0.451-2.8670.294-0.1210.696-1.3311.0420.354-0.844-4.174-0.2720.01
05-1.968-4.1741.31-2.867-4.174-2.867-0.668-2.867-1.186-1.7081.882-0.518-2.867-4.1741.252-1.502
06-2.867-1.186-1.968-4.174-4.174-2.32-1.968-4.174-0.1212.2391.204-0.388-4.174-0.668-1.331-1.968
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10-2.32-0.668-4.174-2.867-0.1210.587-1.968-1.058-0.7521.64-1.502-0.844-1.3311.4260.126-1.186
11-2.867-0.388-4.174-0.032-2.320.197-2.322.324-4.174-1.331-4.1740.197-4.174-0.668-4.174-0.518
12-4.174-4.174-1.968-4.174-4.174-4.1740.966-4.174-4.174-4.174-2.32-4.174-2.32-4.1742.551-2.867
13-4.174-4.174-2.32-4.174-4.174-4.174-4.174-4.174-2.867-4.1742.747-4.174-4.174-4.174-2.867-4.174
14-4.174-4.174-2.867-4.174-4.174-4.174-4.174-4.174-2.32-2.8672.734-1.502-4.174-4.174-4.174-4.174
15-2.32-4.174-4.174-4.174-2.867-4.174-4.174-4.1742.653-1.502-0.272-1.186-1.968-2.32-4.174-4.174
161.9310.0891.725-0.121-1.708-2.32-2.867-4.174-1.331-2.32-0.844-4.174-1.502-4.174-2.32-4.174
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20-4.174-2.867-1.708-2.867-4.174-4.174-4.174-4.174-0.388-0.169-0.5182.596-4.174-4.174-4.174-2.867
21-0.59-4.174-2.32-2.867-0.388-2.32-2.32-2.867-0.388-2.867-2.867-4.1742.555-4.174-0.518-2.867
22-2.867-2.8672.684-4.174-2.867-4.174-2.32-4.174-4.174-4.174-0.219-4.174-4.174-2.867-2.32-4.174
23-4.174-4.174-2.867-2.867-2.867-4.174-2.867-4.174-4.174-2.32-1.7082.731-4.174-4.174-4.174-4.174
24-2.867-4.174-4.174-4.174-2.867-4.174-4.174-2.867-2.867-1.968-2.867-2.867-0.8442.045-0.9451.931