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Model info
Transcription factorZNF143
(GeneCards)
ModelZN143_HUMAN.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length25
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusSYvvdGSMYbMTGGGARdTGTAGTY
Best auROC (human)0.993
Best auROC (mouse)0.987
Peak sets in benchmark (human)28
Peak sets in benchmark (mouse)9
Aligned words386
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyZNF76-like factors {2.3.3.28}
HGNCHGNC:12928
EntrezGeneGeneID:7702
(SSTAR profile)
UniProt IDZN143_HUMAN
UniProt ACP52747
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -6.1740900000000005
0.0005 -3.19034
0.0001 3.33251
GTEx tissue expression atlas ZNF143 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF143 datasets
Motifs in JASPAR
MA0088.1 (znf143; Xenopus laevis)
MA0088.2 (ZNF143; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.013.03.00.013.063.010.018.013.0211.05.012.00.012.05.02.0
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181.08.06.0123.01.02.02.019.01.09.01.030.03.014.015.0145.0
190.00.06.00.01.00.032.00.00.00.024.00.05.00.0311.01.0
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221.01.0353.00.01.00.02.00.00.00.019.00.00.01.02.00.0
230.00.01.01.01.00.01.00.00.02.04.0370.00.00.00.00.0
241.00.00.00.01.00.00.01.01.03.01.01.010.0186.09.0166.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-4.174-0.59-1.968-4.174-0.590.966-0.844-0.272-0.592.171-1.502-0.668-4.174-0.668-1.502-2.32
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23-4.174-4.174-2.867-2.867-2.867-4.174-2.867-4.174-4.174-2.32-1.7082.731-4.174-4.174-4.174-4.174
24-2.867-4.174-4.174-4.174-2.867-4.174-4.174-2.867-2.867-1.968-2.867-2.867-0.8442.045-0.9451.931