We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorZnf143
ModelZN143_MOUSE.H11DI.0.A
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length25
Quality
A
Motif rank
0
ConsensusSCRvdGSMYbMTGGGAvdYGTAGTY
Best auROC (human)0.999
Best auROC (mouse)0.992
Peak sets in benchmark (human)28
Peak sets in benchmark (mouse)9
Aligned words465
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyZNF76-like factors {2.3.3.28}
MGIMGI:1277969
EntrezGeneGeneID:20841
(SSTAR profile)
UniProt IDZN143_MOUSE
UniProt ACO70230
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
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0.0001 3.81691
GTEx tissue expression atlas Znf143 expression
Motifs in JASPAR
MA0088.1 (znf143; Xenopus laevis)
MA0088.2 (ZNF143; Homo sapiens)
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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140.00.01.00.00.00.00.00.04.01.0454.02.00.00.01.00.0
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17102.011.035.052.05.03.04.044.023.021.010.0111.04.00.03.035.0
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2111.01.02.00.09.04.03.01.020.08.012.01.0367.00.022.02.0
220.03.0402.02.03.05.03.02.04.03.030.02.00.01.03.00.0
231.00.05.01.01.03.04.04.01.05.011.0421.02.01.01.02.0
243.00.00.02.01.01.02.05.03.09.06.03.07.0194.018.0209.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
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12-4.336-4.336-1.9-4.336-4.336-4.3361.169-4.336-4.336-4.336-2.159-4.336-2.51-4.3362.509-4.336
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14-4.336-4.336-3.054-4.336-4.336-4.336-4.336-4.336-1.9-3.0542.741-2.51-4.336-4.336-3.054-4.336
15-1.9-4.336-4.336-4.336-3.054-4.336-4.336-4.3362.641-1.379-0.712-0.184-4.336-2.51-4.336-4.336
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23-3.054-4.336-1.695-3.054-3.054-2.159-1.9-1.9-3.054-1.695-0.9462.665-2.51-3.054-3.054-2.51
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