We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorZNF214
(GeneCards)
ModelZN214_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length27
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusdnhhvWTbYKRWKSvnbTYRRKdhhbn
Best auROC (human)0.876
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)2
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words267
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyZNF214-like factors {2.3.3.56}
HGNCHGNC:13006
EntrezGeneGeneID:7761
(SSTAR profile)
UniProt IDZN214_HUMAN
UniProt ACQ9UL59
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 9.385660000000001
0.0005 11.265060000000002
0.0001 15.25031
GTEx tissue expression atlas ZNF214 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF214 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
017.04.032.066.011.08.03.09.014.08.020.09.08.08.043.014.0
0210.013.09.08.014.05.01.08.028.022.018.030.010.08.08.072.0
0313.023.08.018.027.09.01.011.04.025.04.03.09.077.013.019.0
047.031.012.03.041.080.04.09.03.07.014.02.021.012.010.08.0
054.02.03.063.065.04.02.059.01.07.06.026.07.04.01.010.0
060.06.07.064.00.01.01.015.00.04.00.08.01.07.05.0145.0
070.00.01.00.03.011.01.03.00.06.02.05.08.041.057.0126.0
083.01.02.05.03.010.01.044.014.011.02.034.03.064.011.056.0
093.04.01.015.05.016.039.026.00.03.02.011.01.010.012.0116.0
104.01.04.00.021.07.03.02.039.03.08.04.037.05.0123.03.0
1116.02.033.050.012.00.00.04.0109.05.011.013.04.00.01.04.0
122.02.0125.012.01.00.03.03.01.01.025.018.00.01.019.051.0
130.01.03.00.00.03.01.00.08.035.0116.013.03.060.014.07.0
143.05.03.00.020.075.00.04.061.039.025.09.02.011.07.00.0
155.050.04.027.065.022.00.043.04.025.04.02.00.06.05.02.0
161.010.06.057.022.042.013.026.02.00.04.07.06.020.023.025.0
171.01.02.027.00.00.00.072.02.01.03.040.01.03.04.0107.0
181.00.01.02.01.00.00.04.00.05.00.04.05.076.017.0148.0
192.03.02.00.020.015.042.04.02.05.06.05.014.012.0120.012.0
2027.02.07.02.026.02.02.05.0141.07.09.013.03.01.010.07.0
218.05.018.0166.00.00.00.012.03.01.011.013.02.04.04.017.0
222.04.04.03.04.04.01.01.07.08.013.05.025.09.0130.044.0
2316.07.03.012.019.03.00.03.0103.017.012.016.020.010.012.011.0
2445.013.028.072.09.018.01.09.02.05.03.017.011.05.06.020.0
258.017.014.028.013.04.05.019.06.016.08.08.04.019.023.072.0
267.08.06.010.023.07.00.026.020.012.09.09.034.040.026.027.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
01-0.83-1.3540.6521.371-0.395-0.702-1.616-0.589-0.161-0.7020.189-0.589-0.702-0.7020.945-0.161
02-0.487-0.233-0.589-0.702-0.161-1.147-2.525-0.7020.520.2820.0850.588-0.487-0.702-0.7021.457
03-0.2330.326-0.7020.0850.484-0.589-2.525-0.395-1.3540.408-1.354-1.616-0.5891.524-0.2330.138
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07-3.878-3.878-2.525-3.878-1.616-0.395-2.525-1.616-3.878-0.976-1.97-1.147-0.7020.8981.2252.015
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10-1.354-2.525-1.354-3.8780.237-0.83-1.616-1.970.848-1.616-0.702-1.3540.796-1.1471.991-1.616
11-0.03-1.970.6831.095-0.311-3.878-3.878-1.3541.87-1.147-0.395-0.233-1.354-3.878-2.525-1.354
12-1.97-1.972.007-0.311-2.525-3.878-1.616-1.616-2.525-2.5250.4080.085-3.878-2.5250.1381.114
13-3.878-2.525-1.616-3.878-3.878-1.616-2.525-3.878-0.7020.7411.932-0.233-1.6161.276-0.161-0.83
14-1.616-1.147-1.616-3.8780.1891.498-3.878-1.3541.2920.8480.408-0.589-1.97-0.395-0.83-3.878
15-1.1471.095-1.3540.4841.3550.282-3.8780.945-1.3540.408-1.354-1.97-3.878-0.976-1.147-1.97
16-2.525-0.487-0.9761.2250.2820.922-0.2330.447-1.97-3.878-1.354-0.83-0.9760.1890.3260.408
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18-2.525-3.878-2.525-1.97-2.525-3.878-3.878-1.354-3.878-1.147-3.878-1.354-1.1471.5110.0292.175
19-1.97-1.616-1.97-3.8780.189-0.0930.922-1.354-1.97-1.147-0.976-1.147-0.161-0.3111.966-0.311
200.484-1.97-0.83-1.970.447-1.97-1.97-1.1472.127-0.83-0.589-0.233-1.616-2.525-0.487-0.83
21-0.702-1.1470.0852.29-3.878-3.878-3.878-0.311-1.616-2.525-0.395-0.233-1.97-1.354-1.3540.029
22-1.97-1.354-1.354-1.616-1.354-1.354-2.525-2.525-0.83-0.702-0.233-1.1470.408-0.5892.0460.968
23-0.03-0.83-1.616-0.3110.138-1.616-3.878-1.6161.8140.029-0.311-0.030.189-0.487-0.311-0.395
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26-0.83-0.702-0.976-0.4870.326-0.83-3.8780.4470.189-0.311-0.589-0.5890.7120.8730.4470.484