We, Russian scientists of the autosome team, are depressed by the dire events caused by Russian military actions in Ukraine.
We express our condolences to all affected people and sincerely hope for a prompt transition to peace.
Model info
Transcription factorZNF250
(GeneCards)
ModelZN250_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusARTACCATRCTGTTTTGRTTACT
Best auROC (human)0.892
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words358
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyunclassified {2.3.3.0}
HGNCHGNC:13044
EntrezGeneGeneID:58500
(SSTAR profile)
UniProt IDZN250_HUMAN
UniProt ACP15622
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -9.47459
0.0005 -6.29449
0.0001 0.64731
GTEx tissue expression atlas ZNF250 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF250 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0145.013.0252.017.05.01.02.01.03.00.09.02.02.00.06.00.0
021.02.03.049.00.01.00.013.02.013.08.0246.01.01.03.015.0
033.01.00.00.015.00.02.00.08.00.04.02.0258.00.062.03.0
049.0268.02.05.00.01.00.00.00.065.00.03.01.04.00.00.0
050.010.00.00.00.0332.00.06.00.02.00.00.00.06.01.01.0
060.00.00.00.0335.00.08.07.01.00.00.00.03.00.04.00.0
072.079.03.0255.00.00.00.00.00.01.00.011.00.00.00.07.0
080.00.02.00.075.00.04.01.01.00.02.00.076.01.0196.00.0
090.0139.01.012.00.01.00.00.01.0195.00.08.00.01.00.00.0
100.00.00.01.05.05.01.0325.00.00.00.01.00.00.03.017.0
110.00.05.00.04.00.01.00.00.00.04.00.010.03.0330.01.0
120.02.00.012.00.00.00.03.01.07.01.0331.00.00.00.01.0
130.00.00.01.00.00.00.09.00.00.00.01.02.010.01.0334.0
140.00.00.02.00.00.00.010.00.00.00.01.01.010.00.0334.0
150.00.00.01.00.00.01.09.00.00.00.00.02.04.010.0331.0
160.00.02.00.03.00.01.00.01.00.09.01.021.05.0314.01.0
1720.00.05.00.02.00.02.01.0164.06.0141.015.01.00.01.00.0
180.08.01.0178.00.00.00.06.02.02.00.0145.00.00.01.015.0
191.00.00.01.00.00.00.010.00.00.00.02.09.012.022.0301.0
208.02.00.00.012.00.00.00.021.00.00.01.0302.03.04.05.0
213.0299.09.032.00.03.00.02.00.03.01.00.00.04.00.02.0
220.00.00.03.08.024.04.0273.00.00.01.09.04.02.07.023.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.691-0.5312.407-0.27-1.444-2.811-2.262-2.811-1.91-4.125-0.887-2.262-2.262-4.125-1.273-4.125
02-2.811-2.262-1.910.775-4.125-2.811-4.125-0.531-2.262-0.531-1.02.383-2.811-2.811-1.91-0.392
03-1.91-2.811-4.125-4.125-0.392-4.125-2.262-4.125-1.0-4.125-1.65-2.2622.43-4.1251.009-1.91
04-0.8872.468-2.262-1.444-4.125-2.811-4.125-4.125-4.1251.056-4.125-1.91-2.811-1.65-4.125-4.125
05-4.125-0.786-4.125-4.125-4.1252.682-4.125-1.273-4.125-2.262-4.125-4.125-4.125-1.273-2.811-2.811
06-4.125-4.125-4.125-4.1252.691-4.125-1.0-1.127-2.811-4.125-4.125-4.125-1.91-4.125-1.65-4.125
07-2.2621.25-1.912.418-4.125-4.125-4.125-4.125-4.125-2.811-4.125-0.693-4.125-4.125-4.125-1.127
08-4.125-4.125-2.262-4.1251.198-4.125-1.65-2.811-2.811-4.125-2.262-4.1251.211-2.8112.156-4.125
09-4.1251.813-2.811-0.609-4.125-2.811-4.125-4.125-2.8112.151-4.125-1.0-4.125-2.811-4.125-4.125
10-4.125-4.125-4.125-2.811-1.444-1.444-2.8112.661-4.125-4.125-4.125-2.811-4.125-4.125-1.91-0.27
11-4.125-4.125-1.444-4.125-1.65-4.125-2.811-4.125-4.125-4.125-1.65-4.125-0.786-1.912.676-2.811
12-4.125-2.262-4.125-0.609-4.125-4.125-4.125-1.91-2.811-1.127-2.8112.679-4.125-4.125-4.125-2.811
13-4.125-4.125-4.125-2.811-4.125-4.125-4.125-0.887-4.125-4.125-4.125-2.811-2.262-0.786-2.8112.688
14-4.125-4.125-4.125-2.262-4.125-4.125-4.125-0.786-4.125-4.125-4.125-2.811-2.811-0.786-4.1252.688
15-4.125-4.125-4.125-2.811-4.125-4.125-2.811-0.887-4.125-4.125-4.125-4.125-2.262-1.65-0.7862.679
16-4.125-4.125-2.262-4.125-1.91-4.125-2.811-4.125-2.811-4.125-0.887-2.811-0.062-1.4442.626-2.811
17-0.11-4.125-1.444-4.125-2.262-4.125-2.262-2.8111.978-1.2731.827-0.392-2.811-4.125-2.811-4.125
18-4.125-1.0-2.8112.06-4.125-4.125-4.125-1.273-2.262-2.262-4.1251.855-4.125-4.125-2.811-0.392
19-2.811-4.125-4.125-2.811-4.125-4.125-4.125-0.786-4.125-4.125-4.125-2.262-0.887-0.609-0.0172.584
20-1.0-2.262-4.125-4.125-0.609-4.125-4.125-4.125-0.062-4.125-4.125-2.8112.587-1.91-1.65-1.444
21-1.912.577-0.8870.353-4.125-1.91-4.125-2.262-4.125-1.91-2.811-4.125-4.125-1.65-4.125-2.262
22-4.125-4.125-4.125-1.91-1.00.069-1.652.487-4.125-4.125-2.811-0.887-1.65-2.262-1.1270.027