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Model info
Transcription factorZNF250
(GeneCards)
ModelZN250_HUMAN.H11DI.0.C
Model typeDinucleotide PWM
LOGO
LOGO (reverse complement)
Data sourceChIP-Seq
Model releaseHOCOMOCOv11
Model length23
Quality
C
Motif rank
0
ConsensusARTACCATRCTGTTTTGRTTACT
Best auROC (human)0.892
Best auROC (mouse)
Peak sets in benchmark (human)4
Peak sets in benchmark (mouse)
Aligned words358
TF familyMore than 3 adjacent zinc finger factors {2.3.3}
TF subfamilyunclassified {2.3.3.0}
HGNCHGNC:13044
EntrezGeneGeneID:58500
(SSTAR profile)
UniProt IDZN250_HUMAN
UniProt ACP15622
(TFClass)
Comment
Downloadspcm
pwm
alignment
threshold to P-value grid
Standard thresholds
P-value
Threshold
0.001 -9.47459
0.0005 -6.29449
0.0001 0.64731
GTEx tissue expression atlas ZNF250 expression
ReMap ChIP-seq dataset list ZNF250 datasets
Motifs in JASPAR
PCM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
0145.013.0252.017.05.01.02.01.03.00.09.02.02.00.06.00.0
021.02.03.049.00.01.00.013.02.013.08.0246.01.01.03.015.0
033.01.00.00.015.00.02.00.08.00.04.02.0258.00.062.03.0
049.0268.02.05.00.01.00.00.00.065.00.03.01.04.00.00.0
050.010.00.00.00.0332.00.06.00.02.00.00.00.06.01.01.0
060.00.00.00.0335.00.08.07.01.00.00.00.03.00.04.00.0
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080.00.02.00.075.00.04.01.01.00.02.00.076.01.0196.00.0
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100.00.00.01.05.05.01.0325.00.00.00.01.00.00.03.017.0
110.00.05.00.04.00.01.00.00.00.04.00.010.03.0330.01.0
120.02.00.012.00.00.00.03.01.07.01.0331.00.00.00.01.0
130.00.00.01.00.00.00.09.00.00.00.01.02.010.01.0334.0
140.00.00.02.00.00.00.010.00.00.00.01.01.010.00.0334.0
150.00.00.01.00.00.01.09.00.00.00.00.02.04.010.0331.0
160.00.02.00.03.00.01.00.01.00.09.01.021.05.0314.01.0
1720.00.05.00.02.00.02.01.0164.06.0141.015.01.00.01.00.0
180.08.01.0178.00.00.00.06.02.02.00.0145.00.00.01.015.0
191.00.00.01.00.00.00.010.00.00.00.02.09.012.022.0301.0
208.02.00.00.012.00.00.00.021.00.00.01.0302.03.04.05.0
213.0299.09.032.00.03.00.02.00.03.01.00.00.04.00.02.0
220.00.00.03.08.024.04.0273.00.00.01.09.04.02.07.023.0
PWM
AAACAGATCACCCGCTGAGCGGGTTATCTGTT
010.691-0.5312.407-0.27-1.444-2.811-2.262-2.811-1.91-4.125-0.887-2.262-2.262-4.125-1.273-4.125
02-2.811-2.262-1.910.775-4.125-2.811-4.125-0.531-2.262-0.531-1.02.383-2.811-2.811-1.91-0.392
03-1.91-2.811-4.125-4.125-0.392-4.125-2.262-4.125-1.0-4.125-1.65-2.2622.43-4.1251.009-1.91
04-0.8872.468-2.262-1.444-4.125-2.811-4.125-4.125-4.1251.056-4.125-1.91-2.811-1.65-4.125-4.125
05-4.125-0.786-4.125-4.125-4.1252.682-4.125-1.273-4.125-2.262-4.125-4.125-4.125-1.273-2.811-2.811
06-4.125-4.125-4.125-4.1252.691-4.125-1.0-1.127-2.811-4.125-4.125-4.125-1.91-4.125-1.65-4.125
07-2.2621.25-1.912.418-4.125-4.125-4.125-4.125-4.125-2.811-4.125-0.693-4.125-4.125-4.125-1.127
08-4.125-4.125-2.262-4.1251.198-4.125-1.65-2.811-2.811-4.125-2.262-4.1251.211-2.8112.156-4.125
09-4.1251.813-2.811-0.609-4.125-2.811-4.125-4.125-2.8112.151-4.125-1.0-4.125-2.811-4.125-4.125
10-4.125-4.125-4.125-2.811-1.444-1.444-2.8112.661-4.125-4.125-4.125-2.811-4.125-4.125-1.91-0.27
11-4.125-4.125-1.444-4.125-1.65-4.125-2.811-4.125-4.125-4.125-1.65-4.125-0.786-1.912.676-2.811
12-4.125-2.262-4.125-0.609-4.125-4.125-4.125-1.91-2.811-1.127-2.8112.679-4.125-4.125-4.125-2.811
13-4.125-4.125-4.125-2.811-4.125-4.125-4.125-0.887-4.125-4.125-4.125-2.811-2.262-0.786-2.8112.688
14-4.125-4.125-4.125-2.262-4.125-4.125-4.125-0.786-4.125-4.125-4.125-2.811-2.811-0.786-4.1252.688
15-4.125-4.125-4.125-2.811-4.125-4.125-2.811-0.887-4.125-4.125-4.125-4.125-2.262-1.65-0.7862.679
16-4.125-4.125-2.262-4.125-1.91-4.125-2.811-4.125-2.811-4.125-0.887-2.811-0.062-1.4442.626-2.811
17-0.11-4.125-1.444-4.125-2.262-4.125-2.262-2.8111.978-1.2731.827-0.392-2.811-4.125-2.811-4.125
18-4.125-1.0-2.8112.06-4.125-4.125-4.125-1.273-2.262-2.262-4.1251.855-4.125-4.125-2.811-0.392
19-2.811-4.125-4.125-2.811-4.125-4.125-4.125-0.786-4.125-4.125-4.125-2.262-0.887-0.609-0.0172.584
20-1.0-2.262-4.125-4.125-0.609-4.125-4.125-4.125-0.062-4.125-4.125-2.8112.587-1.91-1.65-1.444
21-1.912.577-0.8870.353-4.125-1.91-4.125-2.262-4.125-1.91-2.811-4.125-4.125-1.65-4.125-2.262
22-4.125-4.125-4.125-1.91-1.00.069-1.652.487-4.125-4.125-2.811-0.887-1.65-2.262-1.1270.027